More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10040 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  100 
 
 		 439 aa  869    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  68.72 
 
 		 440 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  69.56 
 
 		 437 aa  585  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  68.04 
 
 		 438 aa  531  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  61.02 
 
 		 460 aa  500  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  55.22 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  55.22 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  55.22 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  53.9 
 
 		 455 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  50.69 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  51.15 
 
 		 459 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  50.69 
 
 		 459 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  49.77 
 
 		 459 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  50.93 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  51.61 
 
 		 456 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  51.95 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  49.3 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  50.35 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  49.06 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  48.25 
 
 		 435 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  49.3 
 
 		 439 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  48.25 
 
 		 435 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  48.25 
 
 		 435 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  52.78 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  49.07 
 
 		 460 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  52.42 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  49.77 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  48.84 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 439 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  49.04 
 
 		 441 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  53.16 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  47.04 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 		 461 aa  382  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  47.97 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  47.32 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 442 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  45.9 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  47.77 
 
 		 456 aa  362  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 444 aa  362  8e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 453 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  46.31 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  48.72 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  47.85 
 
 		 431 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  43.45 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  46.92 
 
 		 449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  43.45 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  43.45 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  43.87 
 
 		 430 aa  353  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  49.16 
 
 		 454 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  47.84 
 
 		 447 aa  352  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.36 
 
 		 437 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  42.01 
 
 		 439 aa  350  4e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  47.52 
 
 		 466 aa  347  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  44.34 
 
 		 443 aa  346  6e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  49.16 
 
 		 449 aa  345  7e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  43.27 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  43.27 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  42.69 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 		 438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 443 aa  343  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  42.35 
 
 		 434 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  42.35 
 
 		 435 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  42.35 
 
 		 435 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  47.23 
 
 		 437 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  42.45 
 
 		 439 aa  342  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  43.1 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.86 
 
 		 438 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  45.31 
 
 		 454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  45.79 
 
 		 444 aa  340  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  44.07 
 
 		 435 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  42.55 
 
 		 435 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  47 
 
 		 457 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  41.8 
 
 		 482 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  45.56 
 
 		 430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 		 442 aa  336  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  47.31 
 
 		 445 aa  335  9e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 439 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 		 432 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  40.79 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  47.22 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  46.99 
 
 		 445 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  46.99 
 
 		 445 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 439 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 432 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 432 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 439 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  47.03 
 
 		 432 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  46.92 
 
 		 460 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 439 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 439 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  41.93 
 
 		 465 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  42.33 
 
 		 433 aa  329  7e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  41.78 
 
 		 437 aa  329  7e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  43.2 
 
 		 439 aa  329  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>