225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  100 
 
 		 253 aa  497  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  67.47 
 
 		 254 aa  333  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  68.55 
 
 		 250 aa  323  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  66.27 
 
 		 254 aa  321  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  61.04 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  65.2 
 
 		 252 aa  311  9e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  66.94 
 
 		 301 aa  310  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  63.49 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  60.48 
 
 		 252 aa  300  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  60.64 
 
 		 254 aa  298  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  60.32 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  60.4 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  60.4 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  60.4 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  56.45 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  58.06 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  60.24 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  62.25 
 
 		 255 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  58.06 
 
 		 252 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  59.44 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  57.43 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  57.65 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  61.2 
 
 		 252 aa  274  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  56.15 
 
 		 255 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  52.19 
 
 		 254 aa  271  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  54 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  57.14 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  57.83 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  57.03 
 
 		 255 aa  268  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  53.97 
 
 		 258 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  58.47 
 
 		 249 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  58.73 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  56.63 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  55.42 
 
 		 257 aa  259  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  52.4 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  52.82 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  55.16 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  45.27 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  43.5 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  43.9 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  43.09 
 
 		 253 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  43.5 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  48.62 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  43.09 
 
 		 253 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  48.62 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  48.99 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  43.9 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  43.5 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  51.63 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  43.5 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  43.5 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  43.5 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 261 aa  231  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  45.6 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  47.43 
 
 		 256 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  46.25 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  47.83 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 255 aa  228  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  46.34 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  51.39 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2722  hypothetical protein  45.6 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  40.48 
 
 		 252 aa  221  6e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 		 250 aa  221  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 		 255 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 254 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  47.62 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  45.45 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  43.6 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 260 aa  218  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  45.2 
 
 		 251 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  48 
 
 		 259 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 		 254 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  41.11 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  47.52 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  41.11 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2481  hypothetical protein  43.48 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29760  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  51.82 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  48.02 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  40.71 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  46.18 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>