More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03649  dihydroxy-acid dehydratase  65.58 
 
 		 616 aa  839    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000570599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4205  dihydroxy-acid dehydratase  65.26 
 
 		 616 aa  838    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00333285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1121  dihydroxy-acid dehydratase  73.81 
 
 		 615 aa  939    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4452  dihydroxy-acid dehydratase  64.08 
 
 		 619 aa  797    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.941603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5128  dihydroxy-acid dehydratase  65.58 
 
 		 613 aa  827    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4126  dihydroxy-acid dehydratase  64.74 
 
 		 624 aa  811    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4137  dihydroxy-acid dehydratase  65.58 
 
 		 616 aa  840    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.129603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4846  dihydroxy-acid dehydratase  63.25 
 
 		 620 aa  812    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0807241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7305  dihydroxy-acid dehydratase  73.37 
 
 		 617 aa  876    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_004310  BR0099  dihydroxy-acid dehydratase  66.07 
 
 		 611 aa  789    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0324836  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4345  dihydroxy-acid dehydratase  65.27 
 
 		 619 aa  808    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5057  dihydroxy-acid dehydratase  65.09 
 
 		 615 aa  821    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2848  dihydroxy-acid dehydratase  66.23 
 
 		 609 aa  793    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.36735  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0445  dihydroxy-acid dehydratase  64.77 
 
 		 616 aa  799    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4057  dihydroxy-acid dehydratase  64.94 
 
 		 616 aa  816    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0469  dihydroxy-acid dehydratase  64.76 
 
 		 615 aa  819    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1304  dihydroxy-acid dehydratase  64.14 
 
 		 628 aa  820    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0302  dihydroxy-acid dehydratase  65.74 
 
 		 618 aa  826    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000297284  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2209  dihydroxyacid dehydratase  69.71 
 
 		 625 aa  862    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4012  dihydroxy-acid dehydratase  64.45 
 
 		 616 aa  826    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0176086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2432  dihydroxy-acid dehydratase  64.24 
 
 		 619 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5433  dihydroxyacid dehydratase  66.44 
 
 		 613 aa  815    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535881  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2730  dihydroxyacid dehydratase  65.09 
 
 		 925 aa  795    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.73004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0213  dihydroxy-acid dehydratase  65.09 
 
 		 614 aa  796    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.450339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3801  dihydroxy-acid dehydratase  67.65 
 
 		 612 aa  835    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.120257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2001  dihydroxy-acid dehydratase  66.88 
 
 		 617 aa  839    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5358  dihydroxy-acid dehydratase  65.74 
 
 		 613 aa  829    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3074  dihydroxy-acid dehydratase  67.65 
 
 		 612 aa  835    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.611367  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0485  dihydroxy-acid dehydratase  64.94 
 
 		 616 aa  816    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.543148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1899  dihydroxy-acid dehydratase  64.24 
 
 		 619 aa  795    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18498  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4757  dihydroxy-acid dehydratase  64.61 
 
 		 616 aa  823    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0890902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3612  dihydroxy-acid dehydratase  64.78 
 
 		 619 aa  809    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4282  dihydroxy-acid dehydratase  65.58 
 
 		 616 aa  840    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4007  dihydroxy-acid dehydratase  64.9 
 
 		 624 aa  812    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1382  dihydroxy-acid dehydratase  64.16 
 
 		 634 aa  817    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.469767  hitchhiker  0.0000362711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3418  dihydroxy-acid dehydratase  68.4 
 
 		 620 aa  841    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0599  dihydroxy-acid dehydratase  66.02 
 
 		 617 aa  837    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0151535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0336  dihydroxy-acid dehydratase  65.58 
 
 		 613 aa  823    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2675  dihydroxy-acid dehydratase  66.5 
 
 		 611 aa  788    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.272323 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3988  dihydroxy-acid dehydratase  65.58 
 
 		 616 aa  839    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0626  dihydroxy-acid dehydratase  66.72 
 
 		 619 aa  840    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546913  normal  0.890987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5002  dihydroxy-acid dehydratase  65.74 
 
 		 613 aa  829    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.138711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1786  dihydroxyacid dehydratase  66.61 
 
 		 625 aa  804    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0348  dihydroxy-acid dehydratase  63.92 
 
 		 615 aa  792    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4162  dihydroxy-acid dehydratase  64.77 
 
 		 616 aa  798    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4515  dihydroxy-acid dehydratase  73.86 
 
 		 617 aa  894    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4066  dihydroxy-acid dehydratase  66.56 
 
 		 619 aa  835    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1784  dihydroxy-acid dehydratase  66.72 
 
 		 615 aa  833    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272247  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0097  dihydroxy-acid dehydratase  66.23 
 
 		 613 aa  790    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0358  dihydroxy-acid dehydratase  63.64 
 
 		 614 aa  806    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.920841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4321  dihydroxy-acid dehydratase  65.63 
 
 		 612 aa  807    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.169432 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0340  dihydroxy-acid dehydratase  66.07 
 
 		 616 aa  831    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2661  dihydroxy-acid dehydratase  66.94 
 
 		 620 aa  815    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3412  dihydroxy-acid dehydratase  65.1 
 
 		 619 aa  789    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3037  dihydroxy-acid dehydratase  64.17 
 
 		 618 aa  800    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3804  dihydroxy-acid dehydratase  66.07 
 
 		 619 aa  834    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0169  dihydroxy-acid dehydratase  65.52 
 
 		 613 aa  790    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1074  dihydroxy-acid dehydratase  63.54 
 
 		 636 aa  822    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.413782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4585  dihydroxy-acid dehydratase  66.61 
 
 		 620 aa  814    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2486  dihydroxy-acid dehydratase  64.61 
 
 		 614 aa  819    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274808  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1189  dihydroxy-acid dehydratase  66.29 
 
 		 619 aa  822    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4231  dihydroxy-acid dehydratase  64.24 
 
 		 619 aa  797    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0292  dihydroxy-acid dehydratase  65.64 
 
 		 616 aa  814    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4250  dihydroxy-acid dehydratase  65.53 
 
 		 615 aa  818    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0971242  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2666  dihydroxy-acid dehydratase  67.21 
 
 		 611 aa  826    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0342  dihydroxy-acid dehydratase  64.55 
 
 		 611 aa  811    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0364  dihydroxy-acid dehydratase  65.75 
 
 		 619 aa  818    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3662  dihydroxy-acid dehydratase  65.43 
 
 		 619 aa  816    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0418  dihydroxyacid dehydratase  65.75 
 
 		 617 aa  818    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0213625  decreased coverage  0.00250401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0424  dihydroxy-acid dehydratase  63.97 
 
 		 619 aa  771    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00413  dihydroxy-acid dehydratase  64.67 
 
 		 599 aa  802    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3546  dihydroxy-acid dehydratase  63.92 
 
 		 619 aa  793    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04630  dihydroxy-acid dehydratase  66.07 
 
 		 612 aa  818    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2756  dihydroxy-acid dehydratase  65.21 
 
 		 646 aa  803    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5178  dihydroxy-acid dehydratase  66.07 
 
 		 613 aa  831    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0157  dihydroxy-acid dehydratase  65.1 
 
 		 616 aa  818    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4135  dihydroxy-acid dehydratase  64.24 
 
 		 619 aa  797    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0713209  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2723  dihydroxy-acid dehydratase  68.35 
 
 		 612 aa  855    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1909  dihydroxy-acid dehydratase  80.66 
 
 		 619 aa  987    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1838  dihydroxyacid dehydratase  63.47 
 
 		 621 aa  813    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0358  dihydroxy-acid dehydratase  65.59 
 
 		 619 aa  819    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1046  dihydroxy-acid dehydratase  66.94 
 
 		 617 aa  833    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.641708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0446  dihydroxy-acid dehydratase  66.07 
 
 		 612 aa  817    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2491  dihydroxy-acid dehydratase  64.55 
 
 		 613 aa  824    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4231  dihydroxy-acid dehydratase  65.58 
 
 		 616 aa  839    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2933  dihydroxy-acid dehydratase  65.36 
 
 		 612 aa  811    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3737  dihydroxy-acid dehydratase  63.36 
 
 		 614 aa  801    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3279  dihydroxy-acid dehydratase  66.02 
 
 		 618 aa  820    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4029  dihydroxy-acid dehydratase  64.9 
 
 		 624 aa  812    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0346  dihydroxy-acid dehydratase  62.28 
 
 		 612 aa  806    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4205  dihydroxy-acid dehydratase  66.23 
 
 		 612 aa  808    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1161  dihydroxy-acid dehydratase  69.57 
 
 		 613 aa  838    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2423  dihydroxy-acid dehydratase  65.58 
 
 		 611 aa  808    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.421855  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0112  dihydroxy-acid dehydratase  66.72 
 
 		 611 aa  813    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1506  dihydroxy-acid dehydratase  64.89 
 
 		 619 aa  803    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189174 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1072  dihydroxy-acid dehydratase  65.21 
 
 		 618 aa  805    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0070  dihydroxy-acid dehydratase  66.12 
 
 		 617 aa  814    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3925  dihydroxy-acid dehydratase  67.81 
 
 		 612 aa  835    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4656  dihydroxy-acid dehydratase  66.07 
 
 		 617 aa  816    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1231  dihydroxy-acid dehydratase  73.32 
 
 		 638 aa  931    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00143562  normal  0.953695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>