More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08650 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 346 aa  678    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  49.24 
 
 		 366 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  40.24 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  37.01 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  37.38 
 
 		 348 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  35.91 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  37.34 
 
 		 314 aa  155  7e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  34.06 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  35.45 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  36.42 
 
 		 327 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  33.74 
 
 		 351 aa  142  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 		 346 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  28.53 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  26.65 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 		 310 aa  116  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  32.06 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  28.03 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  30.91 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  28.84 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  32.94 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  29.18 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.2 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  29.64 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 325 aa  96.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 		 334 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  32.56 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  26.47 
 
 		 343 aa  93.2  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 352 aa  92.8  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  28.83 
 
 		 341 aa  92.8  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  26.38 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  29.02 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  28.61 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  26.8 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  29.35 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  30.72 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 		 348 aa  89.7  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0062  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 336 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  26.71 
 
 		 354 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  30.72 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 		 862 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0337  beta-lactamase domain-containing protein  27.02 
 
 		 336 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  26.35 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  28.24 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  28.7 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.13 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  26.16 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  28.44 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  28.44 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  26.35 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  25.07 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  25.07 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  25.07 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  24.5 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  26.3 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  27.58 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  24.5 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  26.26 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  26.54 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  25.93 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  26.45 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  27.16 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>