More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07720 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  100 
 
 		 160 aa  322  9e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  78.98 
 
 		 161 aa  252  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  69.87 
 
 		 159 aa  237  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  70.51 
 
 		 159 aa  236  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  69.23 
 
 		 159 aa  235  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  67.09 
 
 		 159 aa  233  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  68.83 
 
 		 168 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  68.83 
 
 		 168 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  68.83 
 
 		 168 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  66.88 
 
 		 165 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  68.59 
 
 		 159 aa  231  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  68.87 
 
 		 160 aa  231  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  67.53 
 
 		 165 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  67.31 
 
 		 157 aa  227  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  66.88 
 
 		 158 aa  227  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  67.79 
 
 		 162 aa  222  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  67.32 
 
 		 160 aa  220  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  65.16 
 
 		 167 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  64.74 
 
 		 159 aa  216  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  65.13 
 
 		 154 aa  216  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5790  SsrA-binding protein  69.43 
 
 		 158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.84107  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  64 
 
 		 155 aa  207  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  64.67 
 
 		 160 aa  204  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  66.67 
 
 		 161 aa  204  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  63.33 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  60.76 
 
 		 159 aa  203  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  60.67 
 
 		 167 aa  195  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  59.06 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  62.76 
 
 		 150 aa  187  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  60.81 
 
 		 161 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  59.15 
 
 		 177 aa  186  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  60.4 
 
 		 153 aa  187  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  58.28 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  60 
 
 		 155 aa  184  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  59.31 
 
 		 172 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  59.33 
 
 		 155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  59.44 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  59.33 
 
 		 154 aa  181  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  56 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  56.94 
 
 		 177 aa  180  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  57.24 
 
 		 161 aa  180  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  60.42 
 
 		 155 aa  180  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  56.55 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  58.04 
 
 		 152 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  54.97 
 
 		 157 aa  176  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0867  SsrA-binding protein  55.86 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.609087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  56.64 
 
 		 159 aa  174  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  53.52 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  56.76 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2662  SsrA-binding protein  56.67 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0252069  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1069  SsrA-binding protein  55.41 
 
 		 165 aa  170  7.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.439427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  55.03 
 
 		 155 aa  170  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  55.94 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  52.67 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  53.33 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  53.33 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  53.33 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  53.33 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  53.33 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  52.67 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  53.33 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  53.33 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  54.79 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  53.59 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  56.76 
 
 		 156 aa  167  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  51.3 
 
 		 155 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  53.33 
 
 		 155 aa  166  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  53.69 
 
 		 155 aa  165  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  52 
 
 		 155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  54.36 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  58.99 
 
 		 153 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  52 
 
 		 154 aa  163  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2397  SsrA-binding protein  55.17 
 
 		 158 aa  163  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.013671 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  52 
 
 		 154 aa  163  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 154 aa  163  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  52.63 
 
 		 156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  54.97 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  51.95 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  48.67 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  48.67 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  51.33 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  53.64 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  54.61 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  48.68 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  52.29 
 
 		 157 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  51.92 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  54.48 
 
 		 160 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  54.48 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  52.14 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>