More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  56.44 
 
 		 719 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  53.97 
 
 		 717 aa  694    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  61.24 
 
 		 707 aa  759    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  55.46 
 
 		 712 aa  702    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  59.53 
 
 		 674 aa  670    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  55.96 
 
 		 697 aa  668    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  58.77 
 
 		 702 aa  721    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  55.23 
 
 		 701 aa  700    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  55.51 
 
 		 709 aa  682    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  55.24 
 
 		 736 aa  679    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  59.28 
 
 		 700 aa  755    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  59.6 
 
 		 717 aa  750    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  57.14 
 
 		 719 aa  663    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  52.63 
 
 		 787 aa  670    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  57.39 
 
 		 708 aa  723    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  60.58 
 
 		 714 aa  758    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  57.08 
 
 		 697 aa  743    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  60.58 
 
 		 707 aa  757    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  53.92 
 
 		 759 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 694 aa  1389    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  59.97 
 
 		 685 aa  716    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  54.76 
 
 		 726 aa  700    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  57.87 
 
 		 682 aa  712    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  60.58 
 
 		 707 aa  758    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  62.12 
 
 		 710 aa  781    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  58 
 
 		 689 aa  716    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  51.95 
 
 		 688 aa  620  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.27 
 
 		 699 aa  612  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  48.47 
 
 		 710 aa  608  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  52.93 
 
 		 684 aa  609  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  54.44 
 
 		 670 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  53.39 
 
 		 685 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  51.23 
 
 		 704 aa  600  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  74.44 
 
 		 876 aa  584  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  47.51 
 
 		 690 aa  562  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  47.6 
 
 		 643 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  47.33 
 
 		 508 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  35.29 
 
 		 739 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  31.8 
 
 		 714 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  30.28 
 
 		 689 aa  274  4.0000000000000004e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  36.48 
 
 		 715 aa  273  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.84 
 
 		 689 aa  268  2e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 735 aa  261  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  31.98 
 
 		 736 aa  261  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.25 
 
 		 730 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.85 
 
 		 786 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.62 
 
 		 715 aa  257  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.94 
 
 		 686 aa  257  6e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  34.81 
 
 		 807 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  32.34 
 
 		 728 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  32.34 
 
 		 728 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.2 
 
 		 765 aa  253  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.83 
 
 		 858 aa  251  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.55 
 
 		 763 aa  250  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  32.04 
 
 		 728 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.72 
 
 		 667 aa  248  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  32.26 
 
 		 678 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 		 625 aa  243  6e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 741 aa  243  7.999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  29.99 
 
 		 724 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  30.51 
 
 		 727 aa  242  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  31.76 
 
 		 729 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.61 
 
 		 763 aa  242  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  35.13 
 
 		 797 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  38.24 
 
 		 779 aa  239  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  37.47 
 
 		 515 aa  239  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.13 
 
 		 797 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  32.81 
 
 		 795 aa  239  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  30.78 
 
 		 739 aa  239  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  31.22 
 
 		 728 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  31.22 
 
 		 728 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  32.23 
 
 		 726 aa  238  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.13 
 
 		 768 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  32.15 
 
 		 721 aa  237  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  31.14 
 
 		 620 aa  237  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  32.81 
 
 		 795 aa  236  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  35.13 
 
 		 797 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.88 
 
 		 773 aa  236  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  31.25 
 
 		 727 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.77 
 
 		 694 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.69 
 
 		 876 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.81 
 
 		 741 aa  234  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.89 
 
 		 732 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.61 
 
 		 806 aa  233  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  29.69 
 
 		 749 aa  233  9e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.36 
 
 		 795 aa  232  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  36.34 
 
 		 731 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.6 
 
 		 685 aa  232  2e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  36.82 
 
 		 732 aa  232  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  38.46 
 
 		 768 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  36.34 
 
 		 744 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.61 
 
 		 781 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  35.75 
 
 		 1050 aa  231  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.91 
 
 		 772 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.3 
 
 		 896 aa  231  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  29.82 
 
 		 816 aa  231  4e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.64 
 
 		 718 aa  230  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.57 
 
 		 781 aa  231  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  30.71 
 
 		 634 aa  230  7e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.85 
 
 		 762 aa  230  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>