140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07490 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  100 
 
 
155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  54.17 
 
 
138 aa  130  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
138 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  32.26 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4356  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.509436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2629  thioesterase-like protein  29.69 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293891  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
133 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4363  thioesterase-like protein  31.4 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4340  thioesterase-like protein  31.4 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4208  thioesterase-like  31.4 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0607121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  32.04 
 
 
175 aa  54.7  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_002950  PG1543  thioesterase family protein  29.91 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  32.97 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.09 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  29.06 
 
 
466 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
137 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  30.77 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  32.06 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  36.49 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  29.93 
 
 
297 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.86 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33198  predicted protein  35.29 
 
 
215 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  29.29 
 
 
150 aa  48.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  37.66 
 
 
150 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  26.19 
 
 
154 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
132 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  33.05 
 
 
134 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
132 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
132 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
132 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
132 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  34.72 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  40.91 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  34.72 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2476  thioesterase-like protein  25.81 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.420578  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  31.82 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  28.71 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1366  thioesterase superfamily protein  34.57 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  26.05 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  32.91 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  34.72 
 
 
213 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  32.91 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  34.72 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  33.78 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  31.51 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  34.25 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02175  hypothetical protein  24 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0003  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00198303  unclonable  0.00000000031845 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
135 aa  44.3  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  23.91 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  34.72 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  25.41 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  33.33 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  32.2 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  28.35 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  28.57 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
132 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  32.91 
 
 
180 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>