More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06390 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
488 aa  954    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0789  Leucyl aminopeptidase  60.08 
 
 
455 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1104  Leucyl aminopeptidase  55.41 
 
 
503 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  48.12 
 
 
501 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  47.64 
 
 
491 aa  358  8e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  50.67 
 
 
479 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1180  Leucyl aminopeptidase  53.14 
 
 
485 aa  350  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746121  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1834  leucyl aminopeptidase  49.23 
 
 
502 aa  340  4e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1032  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  46.19 
 
 
616 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  46.5 
 
 
505 aa  330  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1207  leucyl aminopeptidase  51.23 
 
 
527 aa  325  9e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0710  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  50.95 
 
 
488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  47.16 
 
 
482 aa  302  9e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4388  Leucyl aminopeptidase  48.81 
 
 
490 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  47.12 
 
 
487 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  47.87 
 
 
488 aa  296  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1149  Leucyl aminopeptidase  51.74 
 
 
516 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.901079  normal  0.0342275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2924  Leucyl aminopeptidase  49.47 
 
 
524 aa  295  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827489 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  46.76 
 
 
497 aa  289  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0657  leucyl aminopeptidase  53.48 
 
 
488 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0633269  hitchhiker  0.00350753 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0809  Leucyl aminopeptidase  42.09 
 
 
537 aa  288  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  42.22 
 
 
503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  40.76 
 
 
511 aa  285  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0566  leucyl aminopeptidase  42.36 
 
 
478 aa  285  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25920  leucyl aminopeptidase  49.33 
 
 
527 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118194  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4097  leucyl aminopeptidase  45.82 
 
 
518 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2847  Leucyl aminopeptidase  43.01 
 
 
462 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  46.79 
 
 
503 aa  279  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  39.08 
 
 
512 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0849  Leucyl aminopeptidase  41.72 
 
 
491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1125  Leucyl aminopeptidase  39.79 
 
 
491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.013782  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_901  cytosol aminopeptidase/leucyl aminopeptidase  41.69 
 
 
495 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0210903  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3910  leucyl aminopeptidase  42.25 
 
 
491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.723186  normal  0.561505 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  46.67 
 
 
503 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3861  leucyl aminopeptidase  42.25 
 
 
491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  41.76 
 
 
496 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2306  leucyl aminopeptidase  42.95 
 
 
497 aa  273  6e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.942842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1004  Leucyl aminopeptidase  49.73 
 
 
531 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3091  Leucyl aminopeptidase  47.35 
 
 
545 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00268238  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1518  Leucyl aminopeptidase  45.58 
 
 
505 aa  270  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2206  Leucyl aminopeptidase  41.92 
 
 
501 aa  270  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00206778  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  39.17 
 
 
511 aa  270  5.9999999999999995e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0328  leucyl aminopeptidase  41.14 
 
 
530 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0360646  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4007  leucyl aminopeptidase  39.72 
 
 
486 aa  269  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  45.65 
 
 
487 aa  269  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  47.15 
 
 
503 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3836  leucyl aminopeptidase  44.19 
 
 
575 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0130732 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  46.85 
 
 
503 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  46.85 
 
 
503 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  46.85 
 
 
503 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  44.5 
 
 
507 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  43.63 
 
 
528 aa  266  7e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  41.78 
 
 
502 aa  266  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  46.55 
 
 
503 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0913  leucyl aminopeptidase  40.33 
 
 
497 aa  266  8.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  41.05 
 
 
491 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0038  leucyl aminopeptidase  38.69 
 
 
504 aa  265  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  40.6 
 
 
495 aa  265  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  47.63 
 
 
503 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  40.27 
 
 
510 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  47.32 
 
 
503 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  47.63 
 
 
503 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  47.63 
 
 
503 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  47.63 
 
 
503 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  40.49 
 
 
492 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  47.63 
 
 
503 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  47.63 
 
 
503 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1364  Leucyl aminopeptidase  37 
 
 
492 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  46.55 
 
 
503 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  43.58 
 
 
508 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  38.61 
 
 
495 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  37.36 
 
 
495 aa  263  4e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  38.82 
 
 
496 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  44.55 
 
 
496 aa  263  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0903  leucyl aminopeptidase  38.89 
 
 
495 aa  262  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  36.99 
 
 
493 aa  262  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4247  Leucyl aminopeptidase  44.41 
 
 
518 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  39.16 
 
 
500 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4525  Leucyl aminopeptidase  42.94 
 
 
491 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  43.85 
 
 
490 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  45.43 
 
 
496 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4222  Leucyl aminopeptidase  44.41 
 
 
518 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.345657  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10530  leucyl aminopeptidase  46.22 
 
 
498 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46137  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  43.06 
 
 
497 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1124  leucyl aminopeptidase  43.97 
 
 
485 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.67356  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  36.18 
 
 
493 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  45.06 
 
 
506 aa  260  3e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  43.58 
 
 
503 aa  261  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  43.3 
 
 
508 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  37.8 
 
 
501 aa  259  9e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  39.09 
 
 
510 aa  259  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2727  leucyl aminopeptidase  41.71 
 
 
491 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  42.74 
 
 
503 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  36.18 
 
 
493 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2057  Leucyl aminopeptidase  39.65 
 
 
491 aa  257  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099482  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  47.76 
 
 
496 aa  257  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  51.39 
 
 
496 aa  257  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  37.72 
 
 
497 aa  257  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  45.74 
 
 
503 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  43.77 
 
 
496 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>