265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06200 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  100 
 
 		 203 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  61.19 
 
 		 203 aa  229  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  59.9 
 
 		 539 aa  230  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  61.58 
 
 		 204 aa  229  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  56.44 
 
 		 553 aa  228  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  59.9 
 
 		 201 aa  227  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  59.22 
 
 		 522 aa  224  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  57.43 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  60.4 
 
 		 205 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  54.46 
 
 		 549 aa  221  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  56.72 
 
 		 531 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  55.17 
 
 		 541 aa  213  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  53.96 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  53.96 
 
 		 518 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  53.23 
 
 		 539 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  52.74 
 
 		 536 aa  201  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  52 
 
 		 534 aa  194  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  51.47 
 
 		 539 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  51.26 
 
 		 562 aa  184  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  46.35 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  52.71 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  52.71 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  52.71 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  50.99 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  49.26 
 
 		 555 aa  178  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  50 
 
 		 235 aa  175  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  49.5 
 
 		 233 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  50.52 
 
 		 585 aa  155  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  44.6 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  46.05 
 
 		 564 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  42.99 
 
 		 592 aa  151  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  49.26 
 
 		 200 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  43.28 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  45 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  44.5 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  46.82 
 
 		 219 aa  143  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  48.26 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  47.67 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  44.5 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  48.26 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  48.26 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  48.26 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  43.4 
 
 		 229 aa  141  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  48.82 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  43.5 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  47.06 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  47.09 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  45.71 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  46.51 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  46.51 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  46.51 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  50.3 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  46.51 
 
 		 218 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  46.51 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  46.51 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  43.75 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  43.75 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  46.51 
 
 		 218 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  46.47 
 
 		 217 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  43.75 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  45.93 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  43.27 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  32.23 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  43.27 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  43.27 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  39.23 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  44.15 
 
 		 499 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  43.79 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  45.09 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  44.51 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  56.9 
 
 		 510 aa  135  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  43.06 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  43.02 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  44.51 
 
 		 215 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  48.37 
 
 		 571 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  42.11 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  42.31 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  40.38 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  39.91 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  41.86 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  41.86 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  41.98 
 
 		 234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1801  hypothetical protein  42.08 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  40.48 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  44.51 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  41.86 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  38.18 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  32.27 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  41.63 
 
 		 241 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  37.44 
 
 		 246 aa  125  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  34.21 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  44.77 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  44.77 
 
 		 256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  39.11 
 
 		 242 aa  124  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  43.53 
 
 		 259 aa  124  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  40.33 
 
 		 242 aa  124  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  43.27 
 
 		 256 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  43.27 
 
 		 256 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0094  allophanate hydrolase subunit 1  54.55 
 
 		 247 aa  124  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  43.27 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>