More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06140 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  100 
 
 		 379 aa  716    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  62.91 
 
 		 354 aa  356  3.9999999999999996e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  52.14 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  47.11 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  48.54 
 
 		 471 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  36.03 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  35.08 
 
 		 408 aa  149  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  42.24 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  34.81 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 		 363 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 		 343 aa  125  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  36.03 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 428 aa  124  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 		 417 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  35.28 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  30.13 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  30.35 
 
 		 375 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 		 370 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  37.59 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  40.5 
 
 		 370 aa  117  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  36.7 
 
 		 397 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  22.52 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  34.56 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 		 423 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  29.64 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.49 
 
 		 430 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  29.64 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  30.62 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 		 431 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 435 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  34.81 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 		 408 aa  110  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.74 
 
 		 374 aa  110  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 369 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.57 
 
 		 351 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 380 aa  106  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 		 376 aa  106  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  28.42 
 
 		 364 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  34.7 
 
 		 464 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.69 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  30 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  22.01 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  38.06 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  36.86 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  39.08 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0415  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 433 aa  99.8  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 838 aa  99.8  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 		 443 aa  99.8  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 		 371 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  30.29 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  36.73 
 
 		 382 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  32.13 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4202  glycosyl transferase group 1  36.04 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730151  normal  0.251935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 535 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>