More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  100 
 
 		 538 aa  1092    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  47.73 
 
 		 517 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  40.49 
 
 		 522 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.65 
 
 		 732 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.56 
 
 		 567 aa  313  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  41.79 
 
 		 676 aa  276  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.67 
 
 		 490 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.67 
 
 		 490 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.67 
 
 		 490 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.17 
 
 		 493 aa  270  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  37.53 
 
 		 497 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.81 
 
 		 496 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.11 
 
 		 493 aa  264  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13519  hypothetical protein  32.82 
 
 		 512 aa  252  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.57 
 
 		 410 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1296  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.44 
 
 		 414 aa  248  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8771  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.58 
 
 		 547 aa  240  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06070  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  41.28 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.974325  normal  0.0563121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.47 
 
 		 521 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7119  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.72 
 
 		 382 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1912  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.03 
 
 		 664 aa  216  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.05 
 
 		 491 aa  167  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1299  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.17 
 
 		 340 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.67 
 
 		 509 aa  156  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.86 
 
 		 504 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.95 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  28.57 
 
 		 505 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.55 
 
 		 625 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.31 
 
 		 486 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.22 
 
 		 481 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.64 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.28 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.84 
 
 		 336 aa  140  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.84 
 
 		 573 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.03 
 
 		 390 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.25 
 
 		 307 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.19 
 
 		 320 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.67 
 
 		 311 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.23 
 
 		 311 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  28.5 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.23 
 
 		 311 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.07 
 
 		 516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.71 
 
 		 618 aa  134  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.41 
 
 		 478 aa  134  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.53 
 
 		 414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.95 
 
 		 520 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.39 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.56 
 
 		 468 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  31.78 
 
 		 684 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  29.14 
 
 		 420 aa  128  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.9 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.01 
 
 		 394 aa  127  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3959  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.34 
 
 		 463 aa  127  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.95 
 
 		 560 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  33.33 
 
 		 326 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.34 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.09 
 
 		 306 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 		 584 aa  123  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  28.81 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.88 
 
 		 549 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.85 
 
 		 545 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.53 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.4 
 
 		 520 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.53 
 
 		 506 aa  120  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.07 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.34 
 
 		 424 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.44 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09620  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.57 
 
 		 353 aa  118  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.369888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3559  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.95 
 
 		 352 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.79 
 
 		 466 aa  118  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.05 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.53 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.07 
 
 		 434 aa  114  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  31.31 
 
 		 307 aa  113  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  28.77 
 
 		 373 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.84 
 
 		 365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  26.12 
 
 		 734 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.24 
 
 		 526 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.22 
 
 		 379 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.47 
 
 		 699 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.47 
 
 		 699 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.71 
 
 		 499 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.29 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.17 
 
 		 508 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.36 
 
 		 701 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  29.24 
 
 		 395 aa  107  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  31 
 
 		 406 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.33 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3214  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.7 
 
 		 443 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235319 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.25 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.97 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.22 
 
 		 619 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.36 
 
 		 400 aa  105  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.62 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.1 
 
 		 521 aa  104  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.35 
 
 		 434 aa  104  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  27.13 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.69 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.06 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.68 
 
 		 1336 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>