More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05870 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_05870  Maf-like protein  100 
 
 
223 aa  427  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.538428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1041  maf protein  64.81 
 
 
214 aa  234  9e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407711  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4776  Maf-like protein  54.79 
 
 
209 aa  217  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.714834  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6393  Maf-like protein  63.47 
 
 
206 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1838  maf protein  57.6 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.244014  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13311  Maf-like protein  54.75 
 
 
222 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1674  Maf-like protein  51.6 
 
 
209 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1328  Maf-like protein  54.13 
 
 
210 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1292  Maf-like protein  54.13 
 
 
210 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.981627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1309  Maf-like protein  54.13 
 
 
210 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4232  maf protein  58.37 
 
 
219 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337108  normal  0.701882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2443  maf protein  56.74 
 
 
195 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1035  maf protein  53.3 
 
 
221 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.611513 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0846  maf protein  50.23 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7197  Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation-like protein  53.46 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25490  MAF protein  53.15 
 
 
223 aa  181  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.124397  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1013  maf protein  51.36 
 
 
232 aa  178  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.374037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0823  maf protein  50.68 
 
 
211 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.017605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3911  maf protein  50.44 
 
 
223 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.487608  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1140  maf protein  51.53 
 
 
229 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3504  maf protein  50.92 
 
 
203 aa  168  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4366  maf protein  47.69 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0163  Maf-like protein  38.32 
 
 
204 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.74208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0095  maf protein  41.47 
 
 
197 aa  161  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4892  Maf-like protein  44.7 
 
 
195 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21150  MAF protein  43.78 
 
 
235 aa  157  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3574  Maf-like protein  38.12 
 
 
206 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2532  Maf-like protein  39.01 
 
 
206 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0794  maf protein  48.44 
 
 
240 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0145497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0836  Maf-like protein  40.83 
 
 
197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0679365  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1272  maf protein  39.74 
 
 
228 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0851  maf protein  48.4 
 
 
226 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  34.59 
 
 
475 aa  149  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0788  maf protein  40.18 
 
 
199 aa  147  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1128  Maf-like protein  40.28 
 
 
196 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08240  MAF protein  45.22 
 
 
226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05680  MAF protein  45.54 
 
 
231 aa  144  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0768  maf protein  46.31 
 
 
184 aa  141  9e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1318  maf protein  41.48 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138128 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08381  Maf-like protein  44.12 
 
 
186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1594  Maf-like protein  41.79 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.697875  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  43.66 
 
 
484 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16091  Maf-like protein  34.1 
 
 
211 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.257914  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12351  Maf-like protein  33.63 
 
 
214 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0455202 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0769  Maf-like protein  34.1 
 
 
211 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.91985  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0209  Maf-like protein  42.56 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1468  maf protein  37 
 
 
203 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13511  Maf-like protein  30.48 
 
 
203 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467144  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13361  Maf-like protein  29.52 
 
 
203 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.377788  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1258  maf protein  29.77 
 
 
206 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.349097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  38.28 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1652  Maf-like protein  33.18 
 
 
197 aa  99.8  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1542  maf protein  33.96 
 
 
199 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000755022  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  33.17 
 
 
196 aa  99.4  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2269  Maf-like protein  32.09 
 
 
195 aa  98.6  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  32.87 
 
 
203 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  32.41 
 
 
191 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13261  Maf-like protein  28.3 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0698999  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  32.41 
 
 
191 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  32.41 
 
 
191 aa  95.5  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  32.41 
 
 
191 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  36.5 
 
 
194 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  32.41 
 
 
191 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  31.94 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  32.41 
 
 
191 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  31.48 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  35.65 
 
 
207 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14260  maf protein  29.11 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.62439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  37.31 
 
 
191 aa  92.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  34.74 
 
 
198 aa  92.4  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  36.79 
 
 
194 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  32.39 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  34.27 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2400  Maf-like protein  27.23 
 
 
192 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  32.55 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  29.7 
 
 
199 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  31.92 
 
 
200 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1634  maf protein  34.45 
 
 
240 aa  89  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0513  maf protein  29.72 
 
 
192 aa  89  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0115044  hitchhiker  0.0000000008482 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  30.05 
 
 
191 aa  89  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  34.68 
 
 
200 aa  88.6  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  30.15 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  30.15 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  34.27 
 
 
194 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  30.15 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  30.15 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  30.15 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  32.87 
 
 
191 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  30.15 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0649  maf protein  29.69 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733747  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  30.39 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  30.15 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  30.15 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  34.11 
 
 
194 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  33.94 
 
 
194 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2112  Maf-like protein  26.29 
 
 
192 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1933  maf protein  29.05 
 
 
197 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.810739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  31.92 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  30.15 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  31.92 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>