More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05770 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  61.43 
 
 		 503 aa  649    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  65.52 
 
 		 496 aa  636    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  70.97 
 
 		 504 aa  719    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  70.4 
 
 		 510 aa  702    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  63.62 
 
 		 505 aa  651    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  76.54 
 
 		 505 aa  801    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  65.21 
 
 		 500 aa  641    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  63.29 
 
 		 501 aa  646    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  68 
 
 		 498 aa  688    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  69.4 
 
 		 505 aa  732    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  69.58 
 
 		 514 aa  736    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  65.03 
 
 		 514 aa  650    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  71.17 
 
 		 502 aa  699    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  74.85 
 
 		 506 aa  790    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  64.74 
 
 		 499 aa  651    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  62.2 
 
 		 499 aa  636    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  63.55 
 
 		 517 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  70 
 
 		 498 aa  702    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  63.64 
 
 		 510 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  63.8 
 
 		 497 aa  660    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  77.6 
 
 		 503 aa  778    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  62.8 
 
 		 499 aa  639    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  100 
 
 		 504 aa  1034    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  71.37 
 
 		 504 aa  718    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  60.08 
 
 		 505 aa  639    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  63.64 
 
 		 510 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  73.36 
 
 		 505 aa  755    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  71 
 
 		 505 aa  751    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  61.86 
 
 		 507 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  84.72 
 
 		 504 aa  872    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  72.6 
 
 		 504 aa  755    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  63.83 
 
 		 510 aa  656    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  64.21 
 
 		 505 aa  631  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  62.12 
 
 		 500 aa  631  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  64.21 
 
 		 505 aa  628  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  63.24 
 
 		 505 aa  618  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  62.03 
 
 		 505 aa  618  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  62.23 
 
 		 505 aa  620  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  61.08 
 
 		 507 aa  621  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  64.3 
 
 		 506 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  61.4 
 
 		 507 aa  617  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  59.24 
 
 		 504 aa  617  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  63.42 
 
 		 505 aa  616  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  62.43 
 
 		 505 aa  618  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  60.76 
 
 		 507 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  61 
 
 		 499 aa  611  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  60.2 
 
 		 509 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  62.6 
 
 		 499 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  60.96 
 
 		 501 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  62.4 
 
 		 510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  60.16 
 
 		 501 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  60.4 
 
 		 499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  60.16 
 
 		 501 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  60.76 
 
 		 505 aa  601  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  58.73 
 
 		 509 aa  595  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  59.6 
 
 		 505 aa  594  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  59.52 
 
 		 522 aa  590  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  55.78 
 
 		 497 aa  578  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  56.06 
 
 		 498 aa  574  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  56.8 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  57.75 
 
 		 502 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  55.11 
 
 		 494 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  53.48 
 
 		 498 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  53.48 
 
 		 498 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  54.6 
 
 		 496 aa  555  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  54.96 
 
 		 505 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  54.2 
 
 		 496 aa  555  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  54.85 
 
 		 505 aa  555  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  55.09 
 
 		 501 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  54.4 
 
 		 496 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  54.76 
 
 		 504 aa  554  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  56.14 
 
 		 495 aa  553  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  54.4 
 
 		 496 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  54.4 
 
 		 496 aa  554  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  54.2 
 
 		 496 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  54.4 
 
 		 496 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  54.2 
 
 		 496 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  54.4 
 
 		 496 aa  552  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  54.33 
 
 		 496 aa  551  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  54.4 
 
 		 496 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  54.86 
 
 		 493 aa  551  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  54.33 
 
 		 496 aa  550  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  55.27 
 
 		 501 aa  549  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  54.27 
 
 		 501 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  54.76 
 
 		 505 aa  547  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  54.66 
 
 		 498 aa  541  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  53.98 
 
 		 499 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  54.27 
 
 		 501 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  53.98 
 
 		 500 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  56.28 
 
 		 496 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  54.38 
 
 		 499 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  54.91 
 
 		 507 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  54.93 
 
 		 520 aa  542  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  51.88 
 
 		 500 aa  541  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  54.66 
 
 		 494 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  54.66 
 
 		 494 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  54.91 
 
 		 507 aa  544  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  54.91 
 
 		 507 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  54.45 
 
 		 494 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  54.75 
 
 		 495 aa  544  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>