43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04350 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_04350  Protein of unknown function (DUF690)  100 
 
 
519 aa  1050    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6576  protein of unknown function DUF690  39.31 
 
 
540 aa  313  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373249  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3295  protein of unknown function DUF690  34.56 
 
 
496 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061282  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13487  hypothetical protein  30.43 
 
 
482 aa  167  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0376841  normal  0.0257137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1444  hypothetical protein  28.46 
 
 
461 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129092  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3367  protein of unknown function DUF690  28.65 
 
 
472 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0772  hypothetical protein  28.63 
 
 
493 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0073  hypothetical protein  28.29 
 
 
495 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0449137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0412  hypothetical protein  28.65 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.218055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0328  hypothetical protein  28.79 
 
 
512 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0953892  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5778  hypothetical protein  28.49 
 
 
505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981226  normal  0.352766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11813  hypothetical protein  29.17 
 
 
506 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13930  hypothetical protein  28.52 
 
 
495 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.906406  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5462  hypothetical protein  27.27 
 
 
486 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309937  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0074  hypothetical protein  27.67 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0065  hypothetical protein  27.67 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0055  hypothetical protein  27.67 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00921629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10290  hypothetical protein  27.51 
 
 
538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.225236  normal  0.597294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13904  hypothetical protein  25.89 
 
 
480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1123  hypothetical protein  28.35 
 
 
485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1150  hypothetical protein  28.35 
 
 
457 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1140  hypothetical protein  28.35 
 
 
457 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8088  hypothetical protein  24.95 
 
 
483 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5556  hypothetical protein  26.55 
 
 
504 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5959  hypothetical protein  26.55 
 
 
504 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0371  hypothetical protein  28.17 
 
 
516 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0381  hypothetical protein  28.17 
 
 
516 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4962  hypothetical protein  29.16 
 
 
453 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250808  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0360  hypothetical protein  27.98 
 
 
516 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3150  protein of unknown function DUF690  25.29 
 
 
488 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2228  hypothetical protein  24.71 
 
 
458 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359411  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0609  protein of unknown function DUF690  23.77 
 
 
467 aa  87.8  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0941  hypothetical protein  25.2 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15053  normal  0.447115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0396  hypothetical protein  24.35 
 
 
448 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.769323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1208  protein of unknown function DUF690  24.27 
 
 
481 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1440  hypothetical protein  24.71 
 
 
467 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0477  hypothetical protein  23.18 
 
 
479 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0674  hypothetical protein  28.41 
 
 
464 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0690  hypothetical protein  25.94 
 
 
487 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.335063  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3203  protein of unknown function DUF690  34.09 
 
 
459 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.161915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0986  hypothetical protein  22.62 
 
 
453 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0308  hypothetical protein  25.33 
 
 
482 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00549191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8522  protein of unknown function DUF690  22.94 
 
 
510 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.013435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>