16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04320 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04320  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  761    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.271087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6577  hypothetical protein  62.4 
 
 		 442 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.812843  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5490  hypothetical protein  27.68 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12458  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3296  hypothetical protein  31.42 
 
 		 586 aa  92.8  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0120256  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0675  hypothetical protein  28.38 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.230217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0987  hypothetical protein  28.77 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0466  hypothetical protein  26.89 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.042509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0077  hypothetical protein  30.83 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0086  hypothetical protein  30.83 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.884543  normal  0.0136026 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0067  hypothetical protein  30.83 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0999093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0091  hypothetical protein  32.5 
 
 		 465 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466213  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0756  hypothetical protein  29.31 
 
 		 465 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13917  hypothetical protein  40.98 
 
 		 462 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.791401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0397  hypothetical protein  26.24 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.652786  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0334  hypothetical protein  25.68 
 
 		 717 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7886  hypothetical protein  28.41 
 
 		 479 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.0109649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>