More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04200 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  72.37 
 
 
258 aa  387  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1349  methionine aminopeptidase  65.22 
 
 
265 aa  317  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3395  methionine aminopeptidase, type I  66.27 
 
 
264 aa  316  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1076  methionine aminopeptidase  64.43 
 
 
267 aa  311  9e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1048  methionine aminopeptidase  64.43 
 
 
267 aa  311  9e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1064  methionine aminopeptidase  64.43 
 
 
267 aa  311  9e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.304445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  60.47 
 
 
274 aa  310  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5020  methionine aminopeptidase  63.78 
 
 
266 aa  310  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477997  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3684  methionine aminopeptidase, type I  66.93 
 
 
270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0454054  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  60.7 
 
 
274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  57.48 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10748  methionine aminopeptidase  62.45 
 
 
266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.657144  normal  0.278291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4293  methionine aminopeptidase, type I  60 
 
 
281 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4485  methionine aminopeptidase, type I  60.23 
 
 
286 aa  296  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3901  methionine aminopeptidase, type I  58.91 
 
 
281 aa  295  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  54.15 
 
 
272 aa  289  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  56.13 
 
 
271 aa  289  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  55.73 
 
 
272 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  51.78 
 
 
248 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  55.08 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  49.61 
 
 
251 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0649  methionine aminopeptidase, type I  53.58 
 
 
288 aa  268  8e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0604  methionine aminopeptidase, type I  55.64 
 
 
278 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  52.57 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  52.47 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20650  methionine aminopeptidase, type I  55.38 
 
 
281 aa  264  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.589453  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  50.59 
 
 
248 aa  261  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  52.17 
 
 
248 aa  260  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0953  methionine aminopeptidase, type I  52.03 
 
 
275 aa  258  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6027  methionine aminopeptidase, type I  52.69 
 
 
279 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  51.18 
 
 
259 aa  256  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  48.22 
 
 
249 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  48.22 
 
 
249 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  48.62 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  50.59 
 
 
248 aa  253  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  48.43 
 
 
248 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  50.39 
 
 
249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 
255 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 
248 aa  251  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 
248 aa  251  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 
248 aa  251  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 
248 aa  251  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  48.82 
 
 
248 aa  251  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 
248 aa  251  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  51.95 
 
 
251 aa  251  7e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  51.72 
 
 
271 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 
248 aa  250  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3438  methionine aminopeptidase, type I  55.89 
 
 
264 aa  249  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000686227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  52.33 
 
 
259 aa  249  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  49.62 
 
 
256 aa  249  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  51.76 
 
 
251 aa  249  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  53.05 
 
 
255 aa  248  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  47.49 
 
 
262 aa  247  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1149  methionine aminopeptidase, type I  51.13 
 
 
287 aa  247  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  51.17 
 
 
251 aa  246  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  49.43 
 
 
277 aa  244  6.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  47.43 
 
 
248 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  46.92 
 
 
280 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
269 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  48.62 
 
 
249 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  47.93 
 
 
236 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  47.93 
 
 
236 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  47.93 
 
 
236 aa  240  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  46.64 
 
 
249 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  49.21 
 
 
248 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  43.63 
 
 
264 aa  238  8e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3121  methionine aminopeptidase, type I  51.76 
 
 
276 aa  236  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  49.81 
 
 
281 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  44.09 
 
 
279 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2631  methionine aminopeptidase, type I  50.79 
 
 
277 aa  236  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  44.09 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  43.97 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  45.7 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0710  methionine aminopeptidase, type I  50.78 
 
 
270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  49.01 
 
 
251 aa  232  5e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1955  methionine aminopeptidase, type I  51.19 
 
 
264 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0269  methionine aminopeptidase, type I  43.87 
 
 
249 aa  231  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  46.85 
 
 
285 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  46.89 
 
 
236 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  44.66 
 
 
250 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0906  methionine aminopeptidase, type I  46.56 
 
 
255 aa  229  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238805  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  44.66 
 
 
250 aa  229  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2040  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 
264 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2666  methionine aminopeptidase, type I  47.84 
 
 
275 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  46.03 
 
 
248 aa  228  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  42.52 
 
 
279 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  46.06 
 
 
261 aa  228  8e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  45.06 
 
 
247 aa  227  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  42.52 
 
 
279 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0768  methionine aminopeptidase, type I  43.7 
 
 
250 aa  227  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1125  methionine aminopeptidase  45.38 
 
 
287 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  42.52 
 
 
279 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  46.25 
 
 
249 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  46.06 
 
 
281 aa  226  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  44.44 
 
 
263 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  41.9 
 
 
248 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  46.25 
 
 
275 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  43.48 
 
 
268 aa  226  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>