More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04180 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 435 aa  876    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  76.66 
 
 		 436 aa  681    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  70.55 
 
 		 436 aa  640    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  71.75 
 
 		 445 aa  623  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  68.48 
 
 		 441 aa  620  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  68.03 
 
 		 441 aa  614  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  66.89 
 
 		 441 aa  616  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  68.03 
 
 		 441 aa  614  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  68.03 
 
 		 441 aa  614  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  67.87 
 
 		 445 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  65.38 
 
 		 439 aa  593  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  68.09 
 
 		 445 aa  592  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  65.54 
 
 		 441 aa  568  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  65.54 
 
 		 441 aa  567  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  64.3 
 
 		 430 aa  566  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  64.99 
 
 		 430 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  60.32 
 
 		 437 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  61.14 
 
 		 457 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  61.63 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  60.68 
 
 		 437 aa  533  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  62.81 
 
 		 435 aa  530  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  62.79 
 
 		 438 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  61.73 
 
 		 436 aa  525  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  60.82 
 
 		 436 aa  519  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  60.86 
 
 		 432 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  59.68 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  60.55 
 
 		 431 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  59.55 
 
 		 442 aa  508  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  58.94 
 
 		 429 aa  502  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  59.5 
 
 		 432 aa  500  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  59.17 
 
 		 429 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  59.18 
 
 		 436 aa  491  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  54.21 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  56.76 
 
 		 439 aa  478  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  54.75 
 
 		 448 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  54.1 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  54.9 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1727  preprotein translocase subunit SecY  51.38 
 
 		 445 aa  425  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000416171  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0271  preprotein translocase, SecY subunit  50.56 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  47.03 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  48.51 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  48.64 
 
 		 435 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  46.26 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48.74 
 
 		 428 aa  388  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  47.67 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  46.36 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  49.07 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  47.67 
 
 		 447 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  49.21 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  46.36 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  47.15 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  48.42 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  45.93 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  46.98 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  45.25 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  45.25 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  46.98 
 
 		 448 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  46.53 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  45.48 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  47.07 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  46.36 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  45.08 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  45.64 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  45.52 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  45.27 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  46.09 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  44.8 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  46.26 
 
 		 421 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  46.14 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  44.92 
 
 		 429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  45.92 
 
 		 437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.91 
 
 		 419 aa  356  5e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.56 
 
 		 463 aa  353  5e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  45.27 
 
 		 443 aa  352  7e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.35 
 
 		 442 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  44.67 
 
 		 419 aa  350  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 		 443 aa  349  5e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  41.83 
 
 		 500 aa  348  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  44.3 
 
 		 430 aa  346  6e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  42.25 
 
 		 435 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  42.66 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  43.3 
 
 		 418 aa  343  4e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  44.02 
 
 		 437 aa  342  7e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  44.06 
 
 		 446 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  45.27 
 
 		 441 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  43.12 
 
 		 449 aa  339  5e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  42.18 
 
 		 443 aa  338  9e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  41.97 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  44.37 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  43.26 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  41.99 
 
 		 452 aa  336  5e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  43.15 
 
 		 446 aa  335  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  43.29 
 
 		 448 aa  333  3e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  43.82 
 
 		 426 aa  333  4e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  0.00000750325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  43.93 
 
 		 441 aa  332  6e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  43.62 
 
 		 437 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>