171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  100 
 
 
147 aa  297  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  57.53 
 
 
145 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  56.46 
 
 
148 aa  168  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  55.48 
 
 
148 aa  167  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  56.46 
 
 
156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  54.11 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  57.82 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  55.1 
 
 
152 aa  160  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  52.08 
 
 
165 aa  153  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  148  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  51.03 
 
 
149 aa  147  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  140  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  48.98 
 
 
150 aa  140  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  50.68 
 
 
153 aa  138  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  49.32 
 
 
151 aa  136  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  42.07 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  46.9 
 
 
153 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  47.52 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  45.14 
 
 
149 aa  121  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  40.65 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  40.62 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  41.06 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  42.18 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  42.18 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  41.67 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  39.24 
 
 
160 aa  111  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  41.5 
 
 
150 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  104  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  39.73 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  39.71 
 
 
180 aa  97.4  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  36.3 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  36.55 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  39.16 
 
 
158 aa  97.1  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  38.1 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  39.46 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  38.78 
 
 
144 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  37.67 
 
 
146 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  38.78 
 
 
144 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  35.88 
 
 
147 aa  90.5  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  32.88 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  33.1 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  36.81 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  32.61 
 
 
177 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  32.61 
 
 
177 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  32.61 
 
 
177 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  38.33 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  35.86 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  35.92 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  34.33 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  38.78 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  34.59 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  30.23 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  34.25 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.77 
 
 
177 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  29.85 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  30.6 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  35.21 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  32.43 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.07 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  32.52 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  31.51 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  29.71 
 
 
180 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  32.19 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  34.51 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  34.51 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  34.51 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  36 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.07 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.07 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  29.86 
 
 
352 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  30.23 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  29.41 
 
 
185 aa  70.1  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  33.09 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  30.46 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  32.89 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  33.57 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  34.03 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  32.79 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  29.25 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  40.34 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  33.56 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  40.34 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  40.34 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31.11 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  29.93 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  29.93 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4039  hypothetical protein  34.62 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.798553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  26.9 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  28.39 
 
 
337 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  33.04 
 
 
317 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  29.57 
 
 
324 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  27.89 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  30.43 
 
 
317 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2687  hypothetical protein  31.65 
 
 
158 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  26.53 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  28.7 
 
 
318 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4069  hypothetical protein  35.88 
 
 
166 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  28.7 
 
 
318 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  28.43 
 
 
333 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2780  hypothetical protein  31.01 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.189937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>