More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02690 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  100 
 
 
229 aa  457  1e-128  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  87.72 
 
 
226 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.1 
 
 
229 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  82.89 
 
 
227 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  81.14 
 
 
228 aa  364  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  81.14 
 
 
228 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  79.39 
 
 
228 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  81.14 
 
 
228 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  81.14 
 
 
228 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  81.14 
 
 
228 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.95 
 
 
226 aa  360  8e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  75.65 
 
 
226 aa  355  3e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.29 
 
 
226 aa  353  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  75 
 
 
229 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  75.55 
 
 
226 aa  350  9e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.42 
 
 
231 aa  350  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  73.8 
 
 
229 aa  348  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.56 
 
 
226 aa  348  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.24 
 
 
226 aa  346  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.56 
 
 
226 aa  345  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  74.24 
 
 
230 aa  344  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  74.24 
 
 
228 aa  343  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  75 
 
 
225 aa  342  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.25 
 
 
226 aa  338  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  74.67 
 
 
226 aa  331  6e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  76.86 
 
 
227 aa  330  9e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  69.87 
 
 
228 aa  327  8e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  75.55 
 
 
227 aa  325  4e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  70.61 
 
 
229 aa  318  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0896  two component transcriptional regulator, winged helix family  75 
 
 
226 aa  319  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232326  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.95 
 
 
237 aa  313  1e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  66.67 
 
 
226 aa  308  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31880  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  70.18 
 
 
231 aa  296  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2969  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.56 
 
 
246 aa  296  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  60.94 
 
 
234 aa  290  9e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0657  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.25 
 
 
235 aa  279  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.000311431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.09 
 
 
233 aa  277  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.204872  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.78 
 
 
242 aa  256  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.53 
 
 
236 aa  236  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  1.82155e-08 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 
235 aa  236  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  50.67 
 
 
235 aa  235  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  50.67 
 
 
235 aa  235  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.34523e-07  hitchhiker  3.23141e-12 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 
235 aa  235  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  50.67 
 
 
235 aa  234  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  50.67 
 
 
235 aa  234  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  50.67 
 
 
235 aa  234  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  50.67 
 
 
235 aa  234  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  50.67 
 
 
235 aa  234  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  50.67 
 
 
235 aa  234  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  50.67 
 
 
235 aa  234  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  51.91 
 
 
237 aa  233  2e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 
229 aa  232  4e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 
237 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 
230 aa  228  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 
232 aa  228  6e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 
234 aa  225  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 
236 aa  224  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  48.07 
 
 
235 aa  224  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 
232 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  48.9 
 
 
256 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  48.67 
 
 
233 aa  222  4e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 
235 aa  221  6e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 
239 aa  219  2e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.94698e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  48.89 
 
 
235 aa  219  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  48.02 
 
 
233 aa  217  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 
233 aa  217  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
239 aa  217  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 
230 aa  216  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  49.56 
 
 
229 aa  215  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
236 aa  215  5e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 
230 aa  214  6e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 
238 aa  214  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  46.12 
 
 
235 aa  214  8e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 
239 aa  213  1e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  6.52217e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 
239 aa  213  1e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  48.21 
 
 
233 aa  214  1e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 
230 aa  213  2e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.35 
 
 
225 aa  213  2e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 
230 aa  213  3e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 
230 aa  213  3e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 
239 aa  212  3e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.20928e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 
237 aa  213  3e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 
234 aa  212  4e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 
229 aa  212  4e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 
234 aa  212  5e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 
225 aa  211  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 
233 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 
232 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 
231 aa  210  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  46.12 
 
 
239 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 
239 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  45.69 
 
 
239 aa  209  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  45.69 
 
 
239 aa  209  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 
235 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 
226 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  45.69 
 
 
239 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  45.69 
 
 
239 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.67 
 
 
240 aa  210  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  45.69 
 
 
239 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.73192e-15 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  45.69 
 
 
239 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>