More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02110 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  100 
 
 		 512 aa  1026    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  38.92 
 
 		 503 aa  359  6e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  40.36 
 
 		 537 aa  330  4e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  41.73 
 
 		 498 aa  327  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  39.96 
 
 		 498 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  36.31 
 
 		 543 aa  293  4e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  37.57 
 
 		 558 aa  290  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  35.36 
 
 		 562 aa  290  6e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  35.64 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  36.04 
 
 		 537 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  35.4 
 
 		 554 aa  276  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  36.31 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  34.82 
 
 		 492 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  36.44 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  36.44 
 
 		 554 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  34.27 
 
 		 554 aa  272  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  35.4 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  34.69 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  35.9 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  35.9 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  35.9 
 
 		 554 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  34.95 
 
 		 556 aa  270  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  35.28 
 
 		 554 aa  269  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  34.88 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  34.52 
 
 		 555 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  38.93 
 
 		 563 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  35.43 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  35.43 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  34.3 
 
 		 554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  35.22 
 
 		 554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  35.22 
 
 		 554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  34.11 
 
 		 557 aa  267  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  35.22 
 
 		 554 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  35.21 
 
 		 554 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  36.16 
 
 		 554 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.16 
 
 		 554 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  36.16 
 
 		 554 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  36.16 
 
 		 554 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  36.16 
 
 		 554 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  36.16 
 
 		 554 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  34.34 
 
 		 554 aa  266  7e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  36.23 
 
 		 554 aa  266  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  34.55 
 
 		 554 aa  266  7e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  35.21 
 
 		 554 aa  266  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  34.55 
 
 		 554 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  36.16 
 
 		 554 aa  266  8.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  35.96 
 
 		 554 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  38.55 
 
 		 563 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  35.38 
 
 		 554 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  34.36 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  35.92 
 
 		 592 aa  263  4.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  34.36 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  35.9 
 
 		 554 aa  263  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  34.36 
 
 		 554 aa  263  6.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  34.69 
 
 		 554 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  34.17 
 
 		 554 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  34.21 
 
 		 555 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  35.58 
 
 		 554 aa  260  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  32.45 
 
 		 556 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  33.79 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  35.27 
 
 		 596 aa  257  3e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  33.78 
 
 		 554 aa  253  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  32.65 
 
 		 571 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  37.15 
 
 		 564 aa  249  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  32.41 
 
 		 573 aa  244  3e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  32.54 
 
 		 484 aa  243  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  38 
 
 		 563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  37.13 
 
 		 638 aa  239  9e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.04 
 
 		 528 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  34.83 
 
 		 530 aa  216  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.53 
 
 		 660 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.76 
 
 		 660 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.46 
 
 		 666 aa  206  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.63 
 
 		 590 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.39 
 
 		 513 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.66 
 
 		 536 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.62 
 
 		 664 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.66 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.46 
 
 		 513 aa  203  5e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5410  asparagine synthase family amidotransferase  31.82 
 
 		 589 aa  203  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.84 
 
 		 593 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.54 
 
 		 598 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4868  asparagine synthase amidotransferase  31.44 
 
 		 589 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3188  asparagine synthase amidotransferase  31.44 
 
 		 589 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0461  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.74 
 
 		 613 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0508  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.37 
 
 		 626 aa  196  6e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5353  asparagine synthase family amidotransferase  30.87 
 
 		 589 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.4 
 
 		 646 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.18 
 
 		 619 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  32.76 
 
 		 594 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.63 
 
 		 602 aa  192  9e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2442  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.83 
 
 		 607 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0125  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.96 
 
 		 571 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.82 
 
 		 510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.83 
 
 		 635 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0556  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.23 
 
 		 613 aa  191  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.464828  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.36 
 
 		 610 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.82 
 
 		 510 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.82 
 
 		 510 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.82 
 
 		 510 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>