More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02010 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 125 aa  253  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  70.18 
 
 		 123 aa  160  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 127 aa  153  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  69.79 
 
 		 115 aa  146  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  71.28 
 
 		 104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  62.07 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  63.37 
 
 		 113 aa  144  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  61.06 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  61.06 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  58.77 
 
 		 125 aa  140  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  64.08 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  56.76 
 
 		 116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  58.72 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  60.61 
 
 		 126 aa  130  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  57.01 
 
 		 131 aa  129  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  56.52 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 132 aa  127  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  73.75 
 
 		 105 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  51.67 
 
 		 122 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  54.47 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  63.81 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  59.38 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  56.56 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  62.22 
 
 		 120 aa  120  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  60 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  52.48 
 
 		 127 aa  116  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  57.45 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  51.52 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  56.67 
 
 		 116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  44.74 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  48.89 
 
 		 336 aa  103  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  44.74 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  57.69 
 
 		 337 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  49.11 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  54.43 
 
 		 347 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 337 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  57.32 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 137 aa  100  9e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  51.9 
 
 		 349 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  48.78 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  42.24 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.43 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  38.79 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  41.38 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 		 123 aa  84.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  50.63 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  43.16 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  48.05 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  47.89 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  45.57 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  50.7 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  50.7 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  47.22 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  47.22 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  42.5 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.75 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.75 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  47.22 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>