More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01830 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  100 
 
 
351 aa  702    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  69.32 
 
 
355 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  61.38 
 
 
352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  58.72 
 
 
356 aa  398  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  61.16 
 
 
355 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  57.1 
 
 
358 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  59.08 
 
 
363 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  57.39 
 
 
358 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  57.35 
 
 
391 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  57.39 
 
 
358 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  59.18 
 
 
351 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  60.7 
 
 
353 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  57.93 
 
 
359 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  57.1 
 
 
353 aa  368  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0289  histidinol-phosphate aminotransferase  57.5 
 
 
360 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1195  putative aminotransferase  58.55 
 
 
360 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  57.1 
 
 
370 aa  364  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  58.21 
 
 
360 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  58.21 
 
 
359 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  55.4 
 
 
362 aa  352  5e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0303  histidinol-phosphate aminotransferase  60.29 
 
 
356 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  55.31 
 
 
370 aa  349  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4252  histidinol-phosphate aminotransferase  58.72 
 
 
367 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.235656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4682  histidinol-phosphate aminotransferase  58.72 
 
 
367 aa  345  7e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120317  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  53.31 
 
 
367 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  54.62 
 
 
359 aa  332  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  53.12 
 
 
376 aa  327  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  53.67 
 
 
372 aa  326  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  53.74 
 
 
357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  50.99 
 
 
366 aa  314  9.999999999999999e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4514  aminotransferase  53.11 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.550747  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0235  histidinol-phosphate transaminase  48.38 
 
 
365 aa  311  1e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  48.27 
 
 
369 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0971  aminotransferase  48.27 
 
 
369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  47.73 
 
 
372 aa  299  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4029  aminotransferase  46.78 
 
 
372 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  45.2 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1862  aminotransferase  41.98 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  46.22 
 
 
362 aa  248  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  37.57 
 
 
372 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4386  aminotransferase class I and II  45.26 
 
 
333 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.933282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  38.67 
 
 
373 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  43.1 
 
 
370 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  39.06 
 
 
374 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  42.54 
 
 
369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  40.83 
 
 
383 aa  222  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  42.34 
 
 
370 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  40.17 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  41.14 
 
 
374 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  42.26 
 
 
373 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  42.42 
 
 
369 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  41.46 
 
 
369 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  42.04 
 
 
371 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  36.13 
 
 
370 aa  219  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  37.67 
 
 
362 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  44.41 
 
 
362 aa  218  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  42.04 
 
 
370 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  38.2 
 
 
370 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  41.57 
 
 
365 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  41.01 
 
 
364 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0726  histidinol phosphate aminotransferase  43.1 
 
 
351 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  42.9 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  36.77 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  40.92 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  43.39 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.92 
 
 
358 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  41.44 
 
 
370 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  43.16 
 
 
374 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  38.03 
 
 
362 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  38.76 
 
 
363 aa  209  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  38.66 
 
 
374 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  39.55 
 
 
370 aa  209  8e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  42.42 
 
 
376 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  41.69 
 
 
374 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  38.39 
 
 
374 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 
373 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  35.69 
 
 
392 aa  206  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  39.36 
 
 
363 aa  203  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  35.34 
 
 
370 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  35.63 
 
 
370 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  35.76 
 
 
369 aa  203  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
366 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  38.23 
 
 
370 aa  202  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
367 aa  202  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  36.97 
 
 
365 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 
352 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 
352 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  36.68 
 
 
388 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  34.47 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  34.57 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  37.99 
 
 
371 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  35.34 
 
 
370 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  35.34 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  35.34 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  35.34 
 
 
370 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  35.14 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  35.06 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  37.88 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  34.58 
 
 
366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>