163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  100 
 
 		 253 aa  501  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  57.89 
 
 		 251 aa  288  4e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  39.25 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.64 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  37.5 
 
 		 273 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  35.34 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  38.28 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  38.79 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  37.3 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  37.26 
 
 		 267 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  38.31 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  34.54 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  38.25 
 
 		 249 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  38.52 
 
 		 253 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  38.65 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  37.26 
 
 		 251 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  36.03 
 
 		 247 aa  118  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  33.46 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  34.8 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  35.6 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  34.88 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  37.85 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  36.08 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  34.77 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  34.77 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  36.76 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  37.5 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  38.03 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  38.03 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  38.25 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  38.68 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  38.03 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  33.47 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  38.68 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  35.08 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  35.08 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  32.24 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  35.08 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  37.85 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  36.45 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  36.29 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  36.25 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  36.32 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  34.94 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.12 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 402 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  34.4 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.61 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  32.93 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  33.61 
 
 		 244 aa  95.5  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.38 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 		 248 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  36.65 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  35.07 
 
 		 243 aa  85.1  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  33.86 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  38.57 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.18 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  33.6 
 
 		 269 aa  72  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.88 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  35.96 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  31.19 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  29.76 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  29.76 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  28.29 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  32.19 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  33.56 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  33.33 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  31.84 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.67 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  31.39 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  33.33 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  32.67 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  33.56 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  31.17 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  30.95 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.88 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.27 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1791  NmrA family protein  27.73 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  32.39 
 
 		 306 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  31.14 
 
 		 321 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 		 295 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.87 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.21 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.56 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  32.17 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>