82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01490 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_01490  predicted glycosyltransferase  100 
 
 
303 aa  609  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.731654  normal  0.0270435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0132  glycosyl transferase family 2  80.27 
 
 
298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4321  glycosyl transferase family 2  66.9 
 
 
307 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4102  glycosyl transferase family 2  64.86 
 
 
313 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.694392  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13816  L-rhamnosyltransferase  64.41 
 
 
304 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0276  glycosyl transferase family 2  63.18 
 
 
301 aa  345  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0949477  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5080  glycosyl transferase family protein  65.59 
 
 
297 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.566674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5373  glycosyl transferase family protein  65.59 
 
 
297 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4992  glycosyl transferase family protein  65.59 
 
 
297 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1185  glycosyl transferase family protein  60.07 
 
 
304 aa  332  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5619  glycosyl transferase family protein  60.85 
 
 
313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  41.1 
 
 
298 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2348  glycosyl transferase family 2  40.89 
 
 
298 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000992199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  29.74 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 
297 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  25.38 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  34.58 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
340 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0770  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.35 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  38.3 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  24.8 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  25.1 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.12 
 
 
344 aa  64.3  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.11 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  51.09 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 
455 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 
341 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
615 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.88 
 
 
722 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
305 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  32.17 
 
 
337 aa  58.5  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  30.56 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
489 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  29.81 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
308 aa  55.8  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
311 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0780  putative glycosyl transferase  31.03 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.0469615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0877  putative glycosyl transferase  31.03 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.277014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  29.17 
 
 
674 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0843  putative glycosyl transferase  31.25 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000580713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
350 aa  50.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
314 aa  49.3  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  24.45 
 
 
307 aa  49.3  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
671 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  23.6 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  25.6 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.1 
 
 
333 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  34.78 
 
 
954 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1207  glycosyl transferase domain-containing protein  29.79 
 
 
1121 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 
330 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
340 aa  46.6  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0844  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
281 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.649715  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0702  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
315 aa  45.8  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4003  hypothetical protein  28.71 
 
 
635 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.738232  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  33.04 
 
 
997 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
841 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  29.33 
 
 
342 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  21.8 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  25.4 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
298 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
1299 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  24.11 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1264  glycosyl transferase, family 2  35.11 
 
 
1112 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000048928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  29.27 
 
 
1074 aa  42.7  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 
633 aa  42.7  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0298  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
512 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.174752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>