More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01270 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
421 aa  862    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  76.61 
 
 
416 aa  652    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  73.1 
 
 
419 aa  607  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  68.81 
 
 
420 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  70.24 
 
 
418 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  72.38 
 
 
421 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  71.9 
 
 
436 aa  600  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  70.64 
 
 
417 aa  591  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  71.84 
 
 
445 aa  589  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  71.9 
 
 
420 aa  587  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  68.56 
 
 
426 aa  586  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  73.06 
 
 
417 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  72.82 
 
 
417 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  72.82 
 
 
417 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  68.09 
 
 
426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  71.19 
 
 
422 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  70.88 
 
 
419 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  69.72 
 
 
431 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  65.65 
 
 
426 aa  566  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  65.73 
 
 
426 aa  565  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  70.24 
 
 
422 aa  565  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  65.01 
 
 
424 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  66.19 
 
 
422 aa  558  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  69.05 
 
 
419 aa  560  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  67.62 
 
 
423 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  61.94 
 
 
428 aa  548  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  64.86 
 
 
425 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  64.52 
 
 
433 aa  542  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  65.56 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  64.86 
 
 
426 aa  541  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 
428 aa  531  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  63.27 
 
 
423 aa  512  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  62.32 
 
 
420 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  61.65 
 
 
424 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
425 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
417 aa  362  8e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
425 aa  354  1e-96  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
424 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
424 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
425 aa  344  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
424 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
424 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
424 aa  342  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
424 aa  343  5e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
424 aa  343  5e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
424 aa  343  5e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
424 aa  341  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
421 aa  341  1e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
424 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
424 aa  339  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
424 aa  338  8e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  42 
 
 
427 aa  338  8e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
411 aa  338  9e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
428 aa  337  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
428 aa  337  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
425 aa  336  5e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
427 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  41.78 
 
 
502 aa  333  4e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
424 aa  333  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
424 aa  332  6e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
425 aa  332  9e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
424 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
423 aa  332  1e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
425 aa  331  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
425 aa  330  4e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
426 aa  328  9e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
425 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
423 aa  326  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
435 aa  326  5e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
421 aa  325  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
421 aa  325  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
428 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
423 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
420 aa  322  5e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3636  seryl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
413 aa  322  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000529029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
423 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
425 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2307  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
422 aa  321  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000241726  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
426 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
424 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
422 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
423 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
422 aa  319  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
423 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
431 aa  318  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
421 aa  318  1e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
424 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
423 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
427 aa  317  3e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
427 aa  316  4e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
426 aa  316  5e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
425 aa  315  6e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
422 aa  315  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
423 aa  315  9e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
422 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>