More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  100 
 
 		 301 aa  594  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  65.67 
 
 		 300 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  52.96 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  49.68 
 
 		 315 aa  275  8e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  52.75 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  47.77 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  47.71 
 
 		 306 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  47.3 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  47.06 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  45.54 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  46.39 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  47.06 
 
 		 326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  47.35 
 
 		 349 aa  239  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  49.01 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  47.13 
 
 		 315 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  47.13 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  47.13 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  46.82 
 
 		 321 aa  235  7e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  47.85 
 
 		 314 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  46.38 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  46.62 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  46.33 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  45.39 
 
 		 317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  46.53 
 
 		 305 aa  224  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  48.08 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  45.98 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  46.71 
 
 		 314 aa  208  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  39.69 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  40.79 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  44.09 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  44.62 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  38.15 
 
 		 356 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  40.07 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  38.43 
 
 		 277 aa  185  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  37.55 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  42.96 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  40.74 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  38.19 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  41.48 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  41.26 
 
 		 371 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  39.34 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  40.37 
 
 		 358 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.12 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  40.79 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  40.15 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  43.59 
 
 		 277 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  44.32 
 
 		 277 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 278 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  44.32 
 
 		 277 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  36.26 
 
 		 274 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  41.48 
 
 		 367 aa  172  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  38.24 
 
 		 393 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.07 
 
 		 365 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  39.78 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  42.46 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.63 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  42.51 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  40.74 
 
 		 362 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  39.41 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  37.89 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  41.16 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  39.64 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  40.86 
 
 		 279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  38.38 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  37.69 
 
 		 355 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  39.26 
 
 		 359 aa  165  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  41.9 
 
 		 706 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  39.05 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  36.52 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  39.05 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  39.19 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  37.45 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  38.01 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  39.19 
 
 		 364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  39.19 
 
 		 364 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.52 
 
 		 368 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  31.52 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  38.66 
 
 		 358 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.66 
 
 		 358 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  39.19 
 
 		 364 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.63 
 
 		 358 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  38.66 
 
 		 361 aa  162  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.52 
 
 		 362 aa  162  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  38.24 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  35.42 
 
 		 385 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  38.65 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  36.86 
 
 		 359 aa  159  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  37.27 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0175  Prephenate dehydratase  40.55 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 357 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  35.9 
 
 		 359 aa  159  5e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  37 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  38.01 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  34.72 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.87 
 
 		 364 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  37.5 
 
 		 364 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.08 
 
 		 387 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>