More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01040 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01040  transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0791701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0091  transcriptional regulator, IclR family  61.35 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4223  regulatory protein, IclR  52.4 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.918168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1481  transcriptional regulator, IclR family  47.95 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1292  regulatory proteins, IclR  49.26 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4660  IclR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8832  Transcriptional regulator-like protein  55.23 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639619  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1112  IclR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2902  IclR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3792  regulatory proteins, IclR  38.07 
 
 		 260 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.711541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3861  regulatory proteins, IclR  38.07 
 
 		 260 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3788  IclR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 260 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.65348  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1345  transcriptional regulator, IclR family  40.56 
 
 		 233 aa  95.5  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07180  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 240 aa  92.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  36.67 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4749  IclR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 268 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1914  transcriptional regulator, IclR family  38.29 
 
 		 230 aa  84.7  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4661  transcriptional regulator, IclR family  34.33 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4247  regulatory proteins, IclR  36.36 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0872  transcriptional regulator, TrmB  35.75 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2303  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2571  IclR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2760  regulatory protein IclR  28.57 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  37.01 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  35.77 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  32.44 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6621  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 		 273 aa  62  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  36.62 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  38.27 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.63 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  35.34 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3717  IclR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0598808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  38.06 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  30.99 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  35.03 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  25.25 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  34.51 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02755  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  29.9 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  29.21 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2939  transcriptional regulator, IclR family  34.51 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.49 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4121  IclR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101535  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.17 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  29.56 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  35.14 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  33.33 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  34.75 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  32.69 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  27.39 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0796  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.060065  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  34.81 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  30.82 
 
 		 267 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  27.01 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2210  transcriptional regulator, IclR family  32.86 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.871599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 260 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  33.87 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3330  transcriptional regulator, IclR family  33.77 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 260 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>