73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00940 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_00940  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  233  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2172  hypothetical protein  58.26 
 
 
117 aa  124  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  57.27 
 
 
142 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  57.27 
 
 
142 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  57.27 
 
 
142 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2456  hypothetical protein  50.45 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3943  hypothetical protein  51.85 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0080  protein of unknown function DUF952  57.27 
 
 
108 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12720  hypothetical protein  49.09 
 
 
129 aa  104  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3986  protein of unknown function DUF952  53.04 
 
 
374 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  46.79 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2970  hypothetical protein  43.52 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3868  hypothetical protein  44.63 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0861  hypothetical protein  46.79 
 
 
114 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1066  protein of unknown function DUF952  37.17 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  38.89 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.57 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  40.91 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3543  protein of unknown function DUF952  35.58 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0548  hypothetical protein  40.74 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.0576469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2563  protein of unknown function DUF952  35.58 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0102  hypothetical protein  41.82 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  35.19 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000466115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2838  hypothetical protein  34.26 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000244787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4589  protein of unknown function DUF952  39.82 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  hitchhiker  0.00537497 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1680  protein of unknown function DUF952  48.15 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569653  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.46 
 
 
323 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2472  hypothetical protein  35.45 
 
 
106 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0467967  normal  0.531693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1633  protein of unknown function DUF952  40.57 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0372909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2614  hypothetical protein  33.98 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0019859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2538  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.070285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5199  protein of unknown function DUF952  37.11 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2820  hypothetical protein  31.48 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000165343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  37.5 
 
 
286 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2622  hypothetical protein  31.48 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0382701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  35.35 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2813  hypothetical protein  31.48 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0272117  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  31.73 
 
 
333 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3797  protein of unknown function DUF952  34.58 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.899474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3257  hypothetical protein  37.27 
 
 
115 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2571  hypothetical protein  31.48 
 
 
112 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205599  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0093  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4550  hypothetical protein  38.18 
 
 
115 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0465  hypothetical protein  37.38 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4623  hypothetical protein  33.64 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2056  protein of unknown function DUF952  43.88 
 
 
502 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0199379  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0756  hypothetical protein  36.45 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824326  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0792  hypothetical protein  35.51 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2059  protein of unknown function DUF952  36.11 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02570  hypothetical protein  42.55 
 
 
330 aa  57  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.498225  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1067  hypothetical protein  33.64 
 
 
117 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0405  hypothetical protein  31.78 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2383  protein of unknown function DUF952  34.26 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0864  protein of unknown function DUF952  35.51 
 
 
114 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1468  hypothetical protein  33.64 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0387  hypothetical protein  31.13 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.580664  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1917  hypothetical protein  34.21 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0606069  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0585  hypothetical protein  33.96 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2107  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.808396  normal  0.0238058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0787  hypothetical protein  33.02 
 
 
114 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.732307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0556  hypothetical protein  34.23 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0436  hypothetical protein  31.78 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0221  protein of unknown function DUF952  32.99 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12470  hypothetical protein  34.62 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2243  protein of unknown function DUF952  38.54 
 
 
108 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0928716  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4927  protein of unknown function DUF952  40.19 
 
 
107 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1163  hypothetical protein  30.53 
 
 
103 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0556708  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0162  hypothetical protein  31.78 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  0.834789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0192  protein of unknown function DUF952  29.9 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2897  hypothetical protein  29.63 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.359855 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3013  hypothetical protein  27.93 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  0.256865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>