16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00750 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00750  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  752    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 272 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  33.87 
 
 		 272 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 477 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  28.32 
 
 		 306 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  29.34 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  28.86 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  30.07 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  28.42 
 
 		 646 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  32 
 
 		 1635 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1085 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  23.64 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>