16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0046  nuclease (RecB family)-like protein  62.39 
 
 
544 aa  675    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00680  predicted nuclease (RecB family)  100 
 
 
545 aa  1080    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0119  RecB family nuclease, putative  50.32 
 
 
479 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0149  RecB family nuclease, putative  46.35 
 
 
576 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  23.71 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  25.76 
 
 
494 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  22.4 
 
 
512 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  27.09 
 
 
486 aa  63.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  22.4 
 
 
512 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  26.53 
 
 
480 aa  57.8  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  24.15 
 
 
493 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  24.15 
 
 
493 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  29.2 
 
 
490 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  29.74 
 
 
1175 aa  45.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  20.81 
 
 
396 aa  43.9  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  25.73 
 
 
1280 aa  43.9  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>