62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00580 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  100 
 
 		 343 aa  650    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  42.14 
 
 		 343 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  47.08 
 
 		 339 aa  198  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  32.51 
 
 		 651 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  28.49 
 
 		 718 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  36.36 
 
 		 671 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  29.45 
 
 		 718 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  31.4 
 
 		 687 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  30.12 
 
 		 678 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.87 
 
 		 731 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.86 
 
 		 675 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  36.26 
 
 		 708 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  32.23 
 
 		 664 aa  73.6  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  37.2 
 
 		 691 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  31.65 
 
 		 697 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  31.5 
 
 		 739 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  33.12 
 
 		 686 aa  69.3  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  30.36 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5680  copper resistance D domain-containing protein  32.61 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1161  copper resistance D domain protein  33.33 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  31.53 
 
 		 692 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  37.01 
 
 		 651 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  32.3 
 
 		 665 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  32.3 
 
 		 665 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  30.84 
 
 		 641 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  30.84 
 
 		 637 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  30.84 
 
 		 641 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1126  copper resistance D domain-containing protein  34.59 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  33.14 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  33.14 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  31.99 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  31.37 
 
 		 676 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  35.06 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  26.39 
 
 		 687 aa  57.4  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  34.36 
 
 		 631 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5053  copper resistance D  37.93 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5141  copper resistance D domain-containing protein  37.93 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  31.43 
 
 		 309 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  30.63 
 
 		 681 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  32.61 
 
 		 672 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  31.82 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  29.61 
 
 		 646 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5432  copper resistance D domain-containing protein  37.93 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165296  normal  0.69712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  29.01 
 
 		 551 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  34.56 
 
 		 578 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  30.57 
 
 		 671 aa  50.1  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  28.46 
 
 		 299 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  30.37 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  33.58 
 
 		 708 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0922  copper resistance D domain protein  33.33 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  32.03 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  29.63 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 663 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 588 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  29.57 
 
 		 559 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  28.03 
 
 		 549 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  28.03 
 
 		 544 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  30.84 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  28.03 
 
 		 544 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  28.03 
 
 		 547 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  28.03 
 
 		 544 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  28.21 
 
 		 544 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>