More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  61.5 
 
 		 210 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  52.45 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  50.5 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  53.93 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  48.68 
 
 		 193 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  51.1 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  52.78 
 
 		 184 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  42.92 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  45.23 
 
 		 195 aa  160  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  43.13 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  33.17 
 
 		 258 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 227 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  28.8 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  49.33 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  35.51 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  34.75 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  33.09 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  44.59 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  37.96 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  45.76 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  47.46 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>