More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00510 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 		 452 aa  908    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  59.86 
 
 		 425 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  53.94 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  53.12 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  53.69 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  51.38 
 
 		 473 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  50 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  48.27 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  49.65 
 
 		 441 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  48.96 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  50.58 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  48.74 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  46.65 
 
 		 438 aa  385  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  46.84 
 
 		 486 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  46.88 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  47.26 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  45.62 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  47.46 
 
 		 475 aa  356  5e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  45.75 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  44.24 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  45.92 
 
 		 436 aa  342  7e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  37.27 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  37.04 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  41.46 
 
 		 470 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  36.57 
 
 		 437 aa  312  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  36.95 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  36.81 
 
 		 437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  36.72 
 
 		 438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  36.81 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  36.81 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  36.03 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  36.57 
 
 		 437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  36.57 
 
 		 437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  37.39 
 
 		 424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  37.93 
 
 		 442 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  37.22 
 
 		 440 aa  259  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  35.47 
 
 		 469 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  37.93 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  35.08 
 
 		 464 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  36.43 
 
 		 460 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.87 
 
 		 445 aa  246  8e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  33.33 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  34.08 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  33.86 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  32.56 
 
 		 412 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  32.18 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.79 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  30.28 
 
 		 429 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  32.09 
 
 		 439 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  36.01 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  30.77 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  30.37 
 
 		 415 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  30.44 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.16 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.03 
 
 		 449 aa  172  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  32.59 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  32.66 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  31.03 
 
 		 418 aa  161  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.49 
 
 		 417 aa  156  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  28.05 
 
 		 437 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  28.45 
 
 		 574 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  30.97 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  30.93 
 
 		 556 aa  137  5e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  26.27 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  30.97 
 
 		 424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.51 
 
 		 462 aa  126  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  34.18 
 
 		 246 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  25.2 
 
 		 572 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.75 
 
 		 504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  24.74 
 
 		 483 aa  106  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  29.16 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  22.93 
 
 		 642 aa  90.5  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  36.31 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  37.02 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  28.24 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  36.11 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  31.68 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  28.81 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  28.98 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  22.74 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.71 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  28.41 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  28.98 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  28.98 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  28.81 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  27.84 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.73 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  34.78 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  31.75 
 
 		 481 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  27.84 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.1 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 		 490 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.21 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  30.98 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  32.2 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.19 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0949  hypothetical protein  23.02 
 
 		 595 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.38 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  30.32 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  30.32 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>