More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00470 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 331 aa  654    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.402107  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2484  Luciferase-like monooxygenase  62.88 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3717  luciferase-like protein  63.89 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0129729  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07710  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.13 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1881  luciferase family oxidoreductase, group 1  45.06 
 
 		 323 aa  236  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.797974  normal  0.396374 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2497  luciferase family oxidoreductase, group 1  49.19 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  42.3 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  41.49 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.51 
 
 		 338 aa  219  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  42.19 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  40 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0991  luciferase family protein  46.73 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  39.46 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  40.31 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  39.16 
 
 		 351 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  39.16 
 
 		 351 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  42.12 
 
 		 343 aa  215  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  40.99 
 
 		 332 aa  215  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6408  luciferase-like monooxygenase  41.95 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  42.12 
 
 		 343 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  40.87 
 
 		 332 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  41.87 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  40.87 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  39.27 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  40.56 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  39.39 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  40.56 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  40.8 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  41.03 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  40.56 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  39.69 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  42.25 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  41.05 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  40.36 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  37.2 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  39.21 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  39.52 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  40.62 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  40.62 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  40.62 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  40.62 
 
 		 336 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  39.09 
 
 		 333 aa  208  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  40.62 
 
 		 424 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  40.62 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  39.09 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  38.77 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  38.89 
 
 		 331 aa  205  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.27 
 
 		 357 aa  205  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  38.92 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  40 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  41.82 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  40.67 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1187  luciferase family protein  37.42 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  40.55 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  41.85 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  40.25 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3480  luciferase family protein  41.59 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3897  luciferase family protein  38.91 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  38.11 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  39.76 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  37.35 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3277  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.49 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.967037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  40.06 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  38.72 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  37.18 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.39 
 
 		 340 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  38.1 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  41.27 
 
 		 356 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  36.7 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  36.75 
 
 		 341 aa  199  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  37.76 
 
 		 353 aa  198  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  37.7 
 
 		 335 aa  198  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  41.25 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  38.34 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1563  putative oxidoreductase  39.82 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  38.07 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  37.38 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0529886 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1776  luciferase family protein  36.86 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02130  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.6 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0214  luciferase family protein  39.82 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.527708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  39.02 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  36.78 
 
 		 348 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0138  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.19 
 
 		 329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.402113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  41.96 
 
 		 346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  38.32 
 
 		 333 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  41.26 
 
 		 361 aa  195  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  40.24 
 
 		 329 aa  195  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  36.45 
 
 		 335 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  36.45 
 
 		 335 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  36.33 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  37.92 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  39.76 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  38.44 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  36.94 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  37.99 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  36.25 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  36.36 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  35.44 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2678  luciferase family protein  40.12 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0310045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  37.69 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>