More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00460 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  100 
 
 		 921 aa  1823    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  38.4 
 
 		 1088 aa  452  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 1071 aa  432  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  36.29 
 
 		 1022 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  36.39 
 
 		 1020 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  35.25 
 
 		 1025 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  35.21 
 
 		 919 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  35.13 
 
 		 931 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.54 
 
 		 981 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.47 
 
 		 940 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  38.85 
 
 		 1030 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  37.76 
 
 		 989 aa  361  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  32.33 
 
 		 913 aa  360  6e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 950 aa  359  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.15 
 
 		 921 aa  354  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  32.38 
 
 		 941 aa  347  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.04 
 
 		 996 aa  347  8e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  35.24 
 
 		 992 aa  345  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  33.94 
 
 		 1054 aa  345  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  33.74 
 
 		 928 aa  345  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.66 
 
 		 965 aa  343  7e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  34.25 
 
 		 956 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  33.94 
 
 		 908 aa  341  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  32.33 
 
 		 1003 aa  340  5.9999999999999996e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  32.74 
 
 		 934 aa  340  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  32.84 
 
 		 970 aa  340  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  31.73 
 
 		 946 aa  340  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 1048 aa  339  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  33.85 
 
 		 992 aa  337  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  38.19 
 
 		 1014 aa  335  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  39.9 
 
 		 990 aa  330  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.87 
 
 		 964 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  32 
 
 		 1021 aa  328  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.25 
 
 		 930 aa  327  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  34.54 
 
 		 954 aa  326  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  32.49 
 
 		 971 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  29.14 
 
 		 1027 aa  319  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  31.24 
 
 		 993 aa  318  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  37.34 
 
 		 995 aa  318  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  31.55 
 
 		 1008 aa  317  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  33.17 
 
 		 993 aa  317  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  37.27 
 
 		 983 aa  316  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30.47 
 
 		 1017 aa  316  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.37 
 
 		 990 aa  310  9e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  33.94 
 
 		 1010 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32.47 
 
 		 1003 aa  307  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  32.84 
 
 		 965 aa  300  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  30.65 
 
 		 928 aa  300  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  33.26 
 
 		 1013 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  34.26 
 
 		 775 aa  298  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  37.05 
 
 		 937 aa  297  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  31.48 
 
 		 1011 aa  294  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  32.12 
 
 		 1022 aa  292  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  32.18 
 
 		 982 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  33.8 
 
 		 907 aa  290  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  32.98 
 
 		 1034 aa  287  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  33.54 
 
 		 1003 aa  287  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 		 1030 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.99 
 
 		 962 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.18 
 
 		 967 aa  285  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 621 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  36.47 
 
 		 1033 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 		 910 aa  280  6e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  43.26 
 
 		 453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  40.81 
 
 		 496 aa  273  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  35.22 
 
 		 915 aa  271  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 850 aa  270  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 1138 aa  270  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  34.98 
 
 		 788 aa  268  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  34.11 
 
 		 1001 aa  267  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  32.64 
 
 		 790 aa  267  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  35.09 
 
 		 935 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  33.83 
 
 		 1025 aa  265  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  35.33 
 
 		 797 aa  265  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 654 aa  264  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  35.35 
 
 		 963 aa  263  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 622 aa  260  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 755 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.83 
 
 		 981 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  33.95 
 
 		 792 aa  256  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  38.53 
 
 		 926 aa  255  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  38.11 
 
 		 582 aa  249  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  32.11 
 
 		 910 aa  248  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  33.13 
 
 		 1108 aa  247  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  32.2 
 
 		 978 aa  244  7.999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  38.63 
 
 		 994 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.32 
 
 		 632 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  34.74 
 
 		 612 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  34.56 
 
 		 1004 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  34.14 
 
 		 1024 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  27.52 
 
 		 1033 aa  231  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 1319 aa  228  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  32.07 
 
 		 715 aa  224  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  33.03 
 
 		 838 aa  221  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 621 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.52 
 
 		 631 aa  218  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  30.47 
 
 		 783 aa  217  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 1346 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  32.94 
 
 		 915 aa  215  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  33.98 
 
 		 666 aa  213  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>