More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00400 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  100 
 
 
478 aa  955    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  68.59 
 
 
474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  54.01 
 
 
505 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  55.28 
 
 
477 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  54.55 
 
 
491 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  54.31 
 
 
491 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  54.31 
 
 
491 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  52.89 
 
 
514 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  52.8 
 
 
517 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  52.8 
 
 
516 aa  364  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  58.95 
 
 
472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  54.04 
 
 
482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  48.61 
 
 
519 aa  352  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  54.04 
 
 
478 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  43.12 
 
 
463 aa  329  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  48.44 
 
 
421 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  50.71 
 
 
441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  43.52 
 
 
474 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  48.86 
 
 
469 aa  300  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  47.51 
 
 
426 aa  293  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  50.14 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  40.04 
 
 
449 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  41.32 
 
 
540 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  44.78 
 
 
466 aa  278  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  47.83 
 
 
462 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  60.09 
 
 
364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  54.09 
 
 
463 aa  256  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  38.44 
 
 
500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  40.58 
 
 
479 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  55.65 
 
 
241 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  55.23 
 
 
241 aa  247  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  53.16 
 
 
507 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  33.95 
 
 
564 aa  238  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  32.1 
 
 
554 aa  234  3e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  52.74 
 
 
265 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  53.39 
 
 
253 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.38 
 
 
438 aa  219  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  51.5 
 
 
511 aa  218  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  51.9 
 
 
247 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  50.21 
 
 
259 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  50.21 
 
 
239 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  50.42 
 
 
239 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  43.88 
 
 
567 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  45.38 
 
 
571 aa  206  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  42.92 
 
 
558 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  33.73 
 
 
395 aa  201  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  36.48 
 
 
452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  52.48 
 
 
687 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  46.15 
 
 
425 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  48.02 
 
 
519 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  34.25 
 
 
394 aa  190  5.999999999999999e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  46.12 
 
 
255 aa  187  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  45.22 
 
 
404 aa  186  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  44.58 
 
 
369 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  33.25 
 
 
416 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.51 
 
 
237 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  45.38 
 
 
355 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  40.43 
 
 
239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.66 
 
 
238 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  43.46 
 
 
319 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  43.4 
 
 
239 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1155  protein serine/threonine phosphatase  46.93 
 
 
267 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  37.6 
 
 
241 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 
241 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  36.08 
 
 
422 aa  159  8e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  41.74 
 
 
258 aa  159  9e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  42.92 
 
 
361 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  43.23 
 
 
236 aa  157  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  39.5 
 
 
259 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  39.5 
 
 
259 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  37.85 
 
 
276 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  35.56 
 
 
245 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.16 
 
 
271 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  37.6 
 
 
238 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.68 
 
 
470 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  37.71 
 
 
236 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  40.16 
 
 
449 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  34.57 
 
 
245 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  38.58 
 
 
386 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  39.23 
 
 
271 aa  150  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  39.09 
 
 
236 aa  149  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  39.17 
 
 
240 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  43.67 
 
 
381 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.86 
 
 
247 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  35.34 
 
 
254 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  39.06 
 
 
267 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  38.82 
 
 
323 aa  147  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  40.65 
 
 
325 aa  147  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  37.08 
 
 
267 aa  147  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.08 
 
 
261 aa  147  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  34.38 
 
 
257 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  36.63 
 
 
445 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  38.31 
 
 
313 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  37.28 
 
 
262 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  39.3 
 
 
597 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  38.89 
 
 
256 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  38.15 
 
 
296 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  38.56 
 
 
320 aa  144  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  40.24 
 
 
253 aa  144  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.52 
 
 
611 aa  143  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>