More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  78.92 
 
 
181 aa  271  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  77.9 
 
 
182 aa  269  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  77.84 
 
 
187 aa  268  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  77.84 
 
 
175 aa  248  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  77.84 
 
 
175 aa  248  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  77.84 
 
 
175 aa  248  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  76.65 
 
 
182 aa  246  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  67.86 
 
 
177 aa  240  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  76.51 
 
 
173 aa  239  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  69.06 
 
 
182 aa  235  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  74.4 
 
 
178 aa  234  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  75.15 
 
 
176 aa  234  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  75 
 
 
176 aa  233  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  65.91 
 
 
179 aa  230  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  66.47 
 
 
176 aa  229  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  75.74 
 
 
170 aa  227  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  72.25 
 
 
177 aa  227  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  70.17 
 
 
177 aa  227  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  64.91 
 
 
175 aa  226  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  63.64 
 
 
179 aa  222  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  63.43 
 
 
178 aa  221  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  63.74 
 
 
175 aa  221  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  69.64 
 
 
170 aa  219  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  64.29 
 
 
206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  64.12 
 
 
174 aa  215  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  64.5 
 
 
173 aa  215  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  65.71 
 
 
176 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  59.67 
 
 
174 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  67.61 
 
 
179 aa  211  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  62.92 
 
 
193 aa  210  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  60.47 
 
 
181 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  59.88 
 
 
181 aa  204  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  63.33 
 
 
184 aa  202  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  63.64 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  63.95 
 
 
176 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  56.73 
 
 
172 aa  193  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  56.14 
 
 
172 aa  192  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  53.45 
 
 
287 aa  183  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  63.16 
 
 
172 aa  181  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  55.36 
 
 
188 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  53.71 
 
 
178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  64.5 
 
 
228 aa  178  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  55.36 
 
 
188 aa  176  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  54.97 
 
 
176 aa  174  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.28 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  53.53 
 
 
376 aa  170  7.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
180 aa  167  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  53.57 
 
 
378 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  52.05 
 
 
266 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  49.12 
 
 
241 aa  164  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.86 
 
 
189 aa  164  9e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  55.76 
 
 
310 aa  161  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  57.06 
 
 
168 aa  160  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  56.46 
 
 
310 aa  157  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  55.29 
 
 
168 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  48.52 
 
 
571 aa  154  6e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  54.71 
 
 
168 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  54.71 
 
 
168 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  49.7 
 
 
657 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  54.55 
 
 
310 aa  152  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  54.42 
 
 
357 aa  152  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  51.18 
 
 
372 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.41 
 
 
468 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  47.22 
 
 
665 aa  142  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.9 
 
 
196 aa  142  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.7 
 
 
466 aa  141  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  49.7 
 
 
254 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598862 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  43.96 
 
 
629 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  50.86 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  44.19 
 
 
160 aa  138  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  47.31 
 
 
174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  46.86 
 
 
573 aa  137  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  48.33 
 
 
181 aa  137  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.1 
 
 
197 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  49.7 
 
 
376 aa  135  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0973  peptidylprolyl isomerase  41.83 
 
 
197 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0954  peptidylprolyl isomerase  41.83 
 
 
197 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  50.6 
 
 
164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  59.18 
 
 
322 aa  133  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.33 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0540  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  40.87 
 
 
197 aa  132  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  44.94 
 
 
218 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  47.34 
 
 
629 aa  131  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  43.72 
 
 
254 aa  131  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
164 aa  131  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  51.85 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50.68 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  41.92 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  51.72 
 
 
223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  46.75 
 
 
172 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75268  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CPR6 (PPIase) (Rotamase)  47.83 
 
 
366 aa  128  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.681927  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00680  conserved hypothetical protein  44.52 
 
 
155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.310644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  49.07 
 
 
161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.66 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.66 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  45.83 
 
 
533 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04583  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D (PPIase D)(Rotamase D)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4E7]  51.9 
 
 
372 aa  124  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0519322  normal  0.28877 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  45.09 
 
 
178 aa  124  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  46.11 
 
 
156 aa  124  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>