More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00160 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  47.27 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  47.32 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  47.32 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  42.52 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  43.8 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  43.8 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  44.55 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  42.98 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  41.27 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2676  mutT/nudix family protein  43.12 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3983  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  27.42 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 473 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  27.42 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  36.64 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.67 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.67 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.67 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  29.6 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  36.45 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  33.04 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  33.04 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  31.53 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  26.45 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  27.42 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5627  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0133288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  39.18 
 
 		 424 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  30.65 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  30.22 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.31 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  29.91 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  37.17 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  30.16 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  26.12 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  36.63 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3081  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  26.67 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  37.65 
 
 		 383 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  36.28 
 
 		 373 aa  52  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  27.1 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  29.6 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  27.1 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  38.79 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  31 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  34.38 
 
 		 363 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  31.06 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.71 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  31.19 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  33.6 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  39.06 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2559  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.340623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.2 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  26.79 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>