15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00100 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00100  nucleotidyltransferase family protein  100 
 
 		 255 aa  520  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  0.283746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1637  hypothetical protein  63.49 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3528  DNA polymerase beta domain protein region  64.26 
 
 		 257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3751  hypothetical protein  57.55 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2971  DNA polymerase beta domain protein region  46.15 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583646  normal  0.297818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7419  hypothetical protein  37.66 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1987  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1402  DNA polymerase beta domain protein region  36.27 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1754  DNA polymerase beta subunit  32.87 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0999806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1680  DNA polymerase, beta-like region  28.91 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2474  hypothetical protein  29.54 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2811  DNA polymerase beta domain protein region  29.67 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0015  hypothetical protein  29.61 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  39.71 
 
 		 102 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1978  hypothetical protein  25.88 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>