55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0027 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_R0028  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  1.84427e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0027  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  6.19703e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0008  tRNA-Asn  96 
 
 
75 bp  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2267  tRNA-Asn  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0500335  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2221  tRNA-Asn  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1414  tRNA-Asn  88 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.906421  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0763  tRNA-Asn  88 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.366453  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1454  tRNA-Asn  85.33 
 
 
75 bp  61.9  2e-08  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0047  tRNA-Asn  90 
 
 
75 bp  60  8e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0440889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0087  tRNA-Lys  89.8 
 
 
76 bp  58  3e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  5.68391e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0024  tRNA-Lys  89.8 
 
 
76 bp  58  3e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.143684  normal  0.454789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0025  tRNA-Lys  89.8 
 
 
76 bp  58  3e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148774  normal  0.456967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0084  tRNA-Lys  89.8 
 
 
76 bp  58  3e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  3.47447e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1546  tRNA-Asn  94.87 
 
 
76 bp  54  5e-06  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0012  tRNA-Asn  94.29 
 
 
75 bp  54  5e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0025  tRNA-Asn  94.29 
 
 
75 bp  54  5e-06  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.728693  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0629  tRNA-Asn  94.87 
 
 
78 bp  54  5e-06  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0026  tRNA-Asn  92.11 
 
 
75 bp  52  2e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0046  tRNA-Asn  92.11 
 
 
75 bp  52  2e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6038  tRNA-Asn  92.11 
 
 
75 bp  52  2e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  5.94197e-07  hitchhiker  7.71476e-15 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0018  tRNA-Asn  92.11 
 
 
75 bp  52  2e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224402  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4299  tRNA-Asn  92.11 
 
 
75 bp  52  2e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0028  tRNA-Asn  92.11 
 
 
75 bp  52  2e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.227518  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0032  tRNA-Asn  92.11 
 
 
75 bp  52  2e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60180  tRNA-Asn  87.72 
 
 
73 bp  50.1  7e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0014  tRNA-Asn  93.94 
 
 
75 bp  50.1  7e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.566187  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0026  tRNA-Asn  85.96 
 
 
72 bp  50.1  7e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  3.38371e-10  normal  0.10818 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3259  tRNA-Lys  86.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0064  tRNA-Lys  86.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550345  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  86.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569019  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0036  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAValVIMSS1309173  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.124324  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1952  tRNA-Lys  86.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0824  tRNA-Lys  86.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAValVIMSS1309100  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2658  tRNA-Lys  86.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0806589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1370  tRNA-Lys  86.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3206  tRNA-Lys  86.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3244  tRNA-Lys  86.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0043  tRNA-Lys  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.06008e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0044  tRNA-Lys  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.17241e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0042  tRNA-Lys  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.10387e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0014  tRNA-Asn  94.29 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R31  tRNA-Asn  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208957  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA9  tRNA-Asn  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  3.14512e-10  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t11  tRNA-Asn  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.75816  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0061  tRNA-Lys  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0060  tRNA-Lys  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00703391  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t39  tRNA-Asn  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.522109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA46  tRNA-Asn  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00683435  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  96.15 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  85.19 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  1.83291e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>