64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0013 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_R0013  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000305155  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0010  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000473639  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1675  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000825492  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0039  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  hitchhiker  0.000000304321 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0109  tRNA-Tyr  87.27 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0037  tRNA-Tyr  87.27 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.216376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0100  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0046  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0437  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253794  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1328  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.044502  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1717  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000393409  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2231  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000893857  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2193  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000544393  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.63004  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1468  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000829322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0058  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401108  normal  0.738165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0048  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4577  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000592849  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0037  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0086  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00209074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0098  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0192  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000718643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0608  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0854  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000540408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5654  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000770795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5714  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5726  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000809965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0082  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000708983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4769  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000283777  hitchhiker  6.00721e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5144  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000379395  normal  0.810906 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0171  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0235528 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0533  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.30142e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0779  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74653e-30 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0026  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07723  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000630573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5651  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000725819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5679  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000538647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5688  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000511712  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000135792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.875932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000316602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000395282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00144807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0094  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000196241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Tyr-2  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000017627  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2567  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0090  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0637  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000210414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0042  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0072  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0044  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0075  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0044  tRNA-Tyr  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0075  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0037  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000436078  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>