More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2098 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  100 
 
 
461 aa  910    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  49.44 
 
 
472 aa  414  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  48.73 
 
 
472 aa  404  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  49.57 
 
 
471 aa  382  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  46.53 
 
 
472 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  47.31 
 
 
467 aa  365  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  46.11 
 
 
472 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  45.89 
 
 
472 aa  364  2e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  45.55 
 
 
471 aa  362  1e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  46.67 
 
 
468 aa  359  6e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  42.27 
 
 
465 aa  348  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.34 
 
 
513 aa  310  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  40.19 
 
 
460 aa  299  8e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  42.36 
 
 
504 aa  297  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  42.48 
 
 
511 aa  297  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  38 
 
 
485 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  48.48 
 
 
393 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  40.73 
 
 
506 aa  294  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  39.11 
 
 
474 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  39.46 
 
 
464 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  39.11 
 
 
474 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  37.97 
 
 
467 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  37.98 
 
 
468 aa  292  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  38.83 
 
 
458 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  39.87 
 
 
505 aa  291  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  40.36 
 
 
498 aa  290  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.45 
 
 
396 aa  289  7e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  37.79 
 
 
464 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  37.53 
 
 
496 aa  289  9e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  39.73 
 
 
473 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  40.61 
 
 
502 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  43.03 
 
 
380 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  38.63 
 
 
457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  43.62 
 
 
443 aa  286  5e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  38.2 
 
 
463 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  40.75 
 
 
458 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  40.83 
 
 
383 aa  286  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  38.11 
 
 
476 aa  286  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  38.88 
 
 
463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  41.16 
 
 
499 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  40.18 
 
 
476 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  38.57 
 
 
471 aa  283  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  40.24 
 
 
449 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  38 
 
 
450 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.36 
 
 
385 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40.05 
 
 
476 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  38 
 
 
450 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  44.24 
 
 
389 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  40.29 
 
 
503 aa  281  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  37.86 
 
 
467 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  38 
 
 
450 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.71 
 
 
417 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  43.94 
 
 
389 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  39.19 
 
 
502 aa  280  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.81 
 
 
476 aa  280  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  38.66 
 
 
464 aa  280  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  43.03 
 
 
385 aa  280  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  37.92 
 
 
455 aa  280  5e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  40.6 
 
 
396 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  39.14 
 
 
478 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  40.9 
 
 
464 aa  278  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  41.15 
 
 
497 aa  278  2e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  38.68 
 
 
471 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  37.33 
 
 
450 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.57 
 
 
442 aa  277  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  38.92 
 
 
450 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  38.68 
 
 
450 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  45.57 
 
 
442 aa  277  3e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  37.98 
 
 
453 aa  277  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  39.58 
 
 
450 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  38.68 
 
 
450 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.23 
 
 
464 aa  276  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  38.68 
 
 
450 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.63 
 
 
398 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  39.21 
 
 
457 aa  276  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  39.21 
 
 
457 aa  276  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  39.21 
 
 
463 aa  276  8e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  45.42 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  38.48 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  39.16 
 
 
469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  40.05 
 
 
491 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  46.32 
 
 
398 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  38.79 
 
 
446 aa  274  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  38.44 
 
 
451 aa  274  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  44.75 
 
 
386 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  36.76 
 
 
474 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  45.45 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  39.01 
 
 
449 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  37.97 
 
 
451 aa  272  7e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.97 
 
 
472 aa  272  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  37.97 
 
 
451 aa  272  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  40.41 
 
 
386 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  40.17 
 
 
386 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.38 
 
 
398 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  37.24 
 
 
488 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  44 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  39.66 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  38.26 
 
 
476 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  39.66 
 
 
402 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  37.05 
 
 
491 aa  270  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>