More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2093 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2093  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 		 356 aa  736    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  63.53 
 
 		 358 aa  477  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.29 
 
 		 371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60 
 
 		 381 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.4 
 
 		 358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.11 
 
 		 356 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2087  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.26 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122222  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.26 
 
 		 356 aa  437  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.67 
 
 		 354 aa  437  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  58.97 
 
 		 356 aa  432  1e-120  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.54 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.74 
 
 		 362 aa  291  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.18 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.46 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.46 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.46 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.46 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.46 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.46 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.46 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.18 
 
 		 362 aa  288  7e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.18 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.67 
 
 		 351 aa  285  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  41.45 
 
 		 342 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.25 
 
 		 347 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.02 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  43.54 
 
 		 349 aa  279  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0028  radical SAM protein  42.82 
 
 		 396 aa  278  9e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.45 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.29 
 
 		 371 aa  275  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  40.81 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.72 
 
 		 367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.14 
 
 		 360 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  40.81 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2311  radical SAM protein  43.54 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  40 
 
 		 371 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3626  hypothetical protein  40 
 
 		 397 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.09 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.8 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.94 
 
 		 364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.94 
 
 		 364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.17 
 
 		 364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  39.46 
 
 		 398 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1567  hypothetical protein  40.65 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00430195  hitchhiker  0.00703244 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2806  hypothetical protein  39.46 
 
 		 427 aa  264  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.65 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.84 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  40 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  39.82 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2966  radical SAM enzyme, Cfr family  39.26 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.80573 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  40.57 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3089  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.02 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.929572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.44 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  37.57 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  38.92 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  38.76 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.71 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  40.59 
 
 		 339 aa  257  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  38.53 
 
 		 425 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  41.49 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.02 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1380  radical SAM protein  40.75 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  38.74 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  39.89 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2700  radical SAM protein  38.46 
 
 		 390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83245  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  38.66 
 
 		 377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1905  radical SAM protein  39.12 
 
 		 403 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0041  radical SAM protein  37.43 
 
 		 392 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.66 
 
 		 386 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  38.3 
 
 		 364 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  39.83 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1382  radical SAM superfamily protein  38.01 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0050  radical SAM protein  38.01 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.890909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  38.07 
 
 		 348 aa  250  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  37.61 
 
 		 406 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0090  radical SAM protein  38.46 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0076  hypothetical protein  37.67 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  37.68 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.49 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0085  radical SAM enzyme, Cfr family  36.81 
 
 		 404 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0269  hypothetical protein  35.54 
 
 		 410 aa  249  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  37.88 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1640  radical SAM protein  37.39 
 
 		 425 aa  249  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.5 
 
 		 354 aa  249  7e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.428537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4182  radical SAM protein  39.62 
 
 		 374 aa  249  7e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  37.6 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  35.73 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3855  radical SAM enzyme, Cfr family  39.22 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.74079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0077  hypothetical protein  37.4 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0398  radical SAM protein  39.27 
 
 		 414 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0578367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  39 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  37.6 
 
 		 372 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0759  radical SAM protein  38.14 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  37.13 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.86 
 
 		 344 aa  246  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  37.7 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  38.53 
 
 		 376 aa  246  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01053  radical SAM enzyme, Cfr family  40.23 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184624  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06113  radical SAM enzyme, Cfr family  40.23 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245547  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1782  radical SAM protein  37.71 
 
 		 349 aa  245  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>