233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2083 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 323 aa  661    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  32.81 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  29.66 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  27 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  25.68 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  26.56 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  24.4 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  24.92 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  23.7 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  24.18 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  27.15 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  25.3 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  26.28 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  24.24 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  22.18 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  24.67 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  24.67 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  23.91 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  22.6 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  22.48 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  24.37 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  22.83 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  21.96 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  23.79 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  24.22 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  22.67 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  23.45 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  23.45 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  22.83 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  22.97 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  22.96 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  26.61 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.41 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  27.62 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  22.83 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  23.1 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  20.85 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  23.36 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  20.85 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  20.97 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  24.43 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  21.4 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  25.31 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  19.85 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  20.27 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1653  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  23.38 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  23.18 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  20.27 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  24.52 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  22.52 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  26.58 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1076  metallo-beta-lactamase family protein  25.89 
 
 		 196 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253465  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  17.23 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  17.23 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  24.15 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  22.78 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  23.93 
 
 		 250 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.6 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  25.76 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  23.14 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3473  beta-lactamase II  27.54 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00878467  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  20.76 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  22.01 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  26.05 
 
 		 292 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 		 240 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  22 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  23.51 
 
 		 354 aa  53.5  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  24.78 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  29.05 
 
 		 198 aa  52.8  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3460  beta-lactamase II  25 
 
 		 256 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3245  beta-lactamase II  25 
 
 		 256 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138707  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3500  beta-lactamase II  25 
 
 		 256 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 198 aa  52.8  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>