168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2077 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 426 aa  832    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  60.8 
 
 		 437 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  60.51 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  59.48 
 
 		 443 aa  488  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  52.16 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  55.5 
 
 		 452 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  55.27 
 
 		 452 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.69 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  55.04 
 
 		 452 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  49.65 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  49.41 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  49.41 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  49.18 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  49.18 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  49.41 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  49.65 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  49.65 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  49.76 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  49.76 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  49.76 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  50.12 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  48.72 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  44.01 
 
 		 444 aa  355  8.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  49.16 
 
 		 418 aa  355  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  45.08 
 
 		 419 aa  349  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  43.48 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  45.83 
 
 		 408 aa  341  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  43.57 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  45.45 
 
 		 406 aa  332  9e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  41.31 
 
 		 438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  45.96 
 
 		 413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  41.95 
 
 		 431 aa  319  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  40.5 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  45.12 
 
 		 429 aa  312  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  42.34 
 
 		 407 aa  298  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  43.31 
 
 		 430 aa  292  9e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  41.03 
 
 		 429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  42.08 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  40.79 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  35.89 
 
 		 1140 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  34.82 
 
 		 458 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  33.1 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  34.52 
 
 		 425 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  32.33 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  34.43 
 
 		 424 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  35.45 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  31.41 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  35.38 
 
 		 403 aa  192  7e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  33.25 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  31.46 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  33.49 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  31.74 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  33.41 
 
 		 421 aa  186  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  32.45 
 
 		 431 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  32.2 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  32.1 
 
 		 417 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  32.94 
 
 		 428 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  31.89 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  32.7 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  33.57 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  32.6 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  33.81 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  29.1 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  31.82 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  33.57 
 
 		 423 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  33.57 
 
 		 423 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  33.57 
 
 		 423 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  33.57 
 
 		 423 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  30.99 
 
 		 428 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  30.84 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  32.52 
 
 		 415 aa  179  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  31.88 
 
 		 424 aa  176  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  30.21 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  31.31 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  32.56 
 
 		 437 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  32.55 
 
 		 423 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  32.55 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  30.07 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  32.15 
 
 		 423 aa  169  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  33.03 
 
 		 436 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  32.4 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  31.95 
 
 		 426 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  30.63 
 
 		 431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  30.26 
 
 		 412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  31.53 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  33.49 
 
 		 412 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  31.95 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  30.65 
 
 		 471 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  32.76 
 
 		 408 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  33.65 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  32.52 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  27.44 
 
 		 433 aa  149  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  27.85 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  30.79 
 
 		 428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  30.02 
 
 		 444 aa  146  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 488 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  29.51 
 
 		 457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  29.18 
 
 		 413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  30.26 
 
 		 429 aa  140  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  28.21 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>