More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2067 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2067  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0285  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0259  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0232  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  227  9e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2111  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  225  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.274571  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0341  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  224  4e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418227  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1508  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1781  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0361  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  210  9e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000245194  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2280  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.704245  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  44.63 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  44.07 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  43.5 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  44.07 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  44.07 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  44.07 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  39.13 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  42.13 
 
 		 184 aa  167  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  42.94 
 
 		 186 aa  167  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  42.94 
 
 		 186 aa  167  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  44.44 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  45.56 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  42.08 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  41.81 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  38.92 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1745  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  41.62 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  40.54 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  39.89 
 
 		 186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  39.13 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  42.16 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  42.78 
 
 		 182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  41.81 
 
 		 186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  37.84 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  37.84 
 
 		 187 aa  161  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  37.84 
 
 		 185 aa  160  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 183 aa  160  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  38.59 
 
 		 186 aa  160  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 185 aa  159  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  40 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  41.81 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  41.81 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  40 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  41.08 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  39.34 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  44.38 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  42.7 
 
 		 182 aa  158  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  40.68 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  41.24 
 
 		 186 aa  158  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  40.22 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  35.33 
 
 		 184 aa  157  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  38.38 
 
 		 185 aa  157  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  39.46 
 
 		 185 aa  157  9e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 184 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  41.85 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2593  ribosome recycling factor  45.61 
 
 		 182 aa  156  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.471073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>