More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2008 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  100 
 
 
404 aa  837    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  68.91 
 
 
396 aa  567  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  64.51 
 
 
396 aa  526  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  64.51 
 
 
396 aa  519  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1696  cysteine desulfurase  62.44 
 
 
396 aa  510  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  62.95 
 
 
396 aa  504  1e-141  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0291  cysteine desulfurase  60.88 
 
 
393 aa  495  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0238  putative cysteine desulfurase  60.36 
 
 
393 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0265  cysteine desulfurase, putative  60.36 
 
 
393 aa  491  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1486  cysteine desulfurase/aminotransferase, IscS/NifS family  60.1 
 
 
392 aa  483  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  46.46 
 
 
396 aa  358  8e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  46.98 
 
 
400 aa  350  3e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.29 
 
 
400 aa  345  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  45.14 
 
 
393 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  46.49 
 
 
398 aa  342  5e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  45.93 
 
 
404 aa  342  7e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  47.24 
 
 
400 aa  342  8e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  45.81 
 
 
384 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  46.65 
 
 
394 aa  340  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  46.34 
 
 
389 aa  338  9e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  45.29 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  45.29 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  45.17 
 
 
384 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  46.07 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  44.76 
 
 
389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  43.7 
 
 
402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  45.41 
 
 
384 aa  336  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  45.69 
 
 
392 aa  335  7.999999999999999e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  44.79 
 
 
391 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  46.37 
 
 
405 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  47.24 
 
 
402 aa  333  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.04 
 
 
404 aa  333  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  44.87 
 
 
417 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  45.41 
 
 
394 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  45.57 
 
 
391 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  44.62 
 
 
407 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  44.3 
 
 
403 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  45.62 
 
 
394 aa  330  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  44.5 
 
 
388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.72 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  45.14 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  43.46 
 
 
391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  45.93 
 
 
401 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  43.72 
 
 
414 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  45.93 
 
 
401 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  42.93 
 
 
402 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  42.89 
 
 
402 aa  322  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  46.19 
 
 
401 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  46.61 
 
 
386 aa  322  8e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  45.74 
 
 
404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  43.75 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  42.78 
 
 
397 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  43.72 
 
 
382 aa  317  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  43.62 
 
 
398 aa  317  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.82 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  43.34 
 
 
388 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.82 
 
 
382 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  41.93 
 
 
507 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  41.81 
 
 
400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  43.15 
 
 
404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  43.83 
 
 
404 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  42.89 
 
 
404 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  43.62 
 
 
397 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  42.89 
 
 
404 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  42.89 
 
 
404 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  42.89 
 
 
404 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  42.34 
 
 
400 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  43.15 
 
 
404 aa  310  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  43.26 
 
 
396 aa  310  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  42.34 
 
 
407 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  42.34 
 
 
407 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  42.34 
 
 
407 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  42.34 
 
 
407 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  42.08 
 
 
407 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  42.34 
 
 
407 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  42.64 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  42.64 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  42.64 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  42.64 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  42.64 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  42.08 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  42.64 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  42.64 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  41.15 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  42.64 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  42.64 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  42.64 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  42.93 
 
 
399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  43.12 
 
 
405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  42.31 
 
 
395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  42.08 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  42.49 
 
 
422 aa  306  3e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  42.38 
 
 
404 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  43.26 
 
 
407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  41.82 
 
 
407 aa  305  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  42.86 
 
 
407 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  41.3 
 
 
407 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  41.3 
 
 
407 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  41.3 
 
 
407 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  41.04 
 
 
407 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>