287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2007 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  100 
 
 		 324 aa  667    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  66.67 
 
 		 330 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  66.87 
 
 		 329 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  68.17 
 
 		 333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  66.67 
 
 		 330 aa  462  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  68.18 
 
 		 330 aa  463  1e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  65.85 
 
 		 323 aa  454  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  64.62 
 
 		 323 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  64.62 
 
 		 323 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  64.62 
 
 		 323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  40.63 
 
 		 291 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.63 
 
 		 291 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.02 
 
 		 284 aa  186  6e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.38 
 
 		 293 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.6 
 
 		 296 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.79 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.57 
 
 		 309 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.54 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.67 
 
 		 306 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.38 
 
 		 329 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.19 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.19 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  35.26 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.43 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.8 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.81 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.12 
 
 		 284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.12 
 
 		 284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.17 
 
 		 286 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.59 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.01 
 
 		 280 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.05 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.97 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.72 
 
 		 288 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.12 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.86 
 
 		 286 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.32 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  32 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  33.54 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.28 
 
 		 278 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  30.9 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.77 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.53 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  28.57 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  30.37 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.86 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  42.11 
 
 		 182 aa  99  9e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.61 
 
 		 137 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  43.94 
 
 		 125 aa  96.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0302  scaffold protein  44.96 
 
 		 142 aa  96.7  5e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.67 
 
 		 138 aa  95.9  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  40.91 
 
 		 149 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  43.41 
 
 		 128 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  40.91 
 
 		 124 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  41.67 
 
 		 143 aa  94  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.41 
 
 		 207 aa  93.6  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  40.6 
 
 		 127 aa  93.2  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  39.1 
 
 		 138 aa  93.6  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  40 
 
 		 139 aa  92.8  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  38.35 
 
 		 132 aa  92.4  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  41.35 
 
 		 143 aa  92.4  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.1 
 
 		 139 aa  92.8  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.6 
 
 		 142 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.1 
 
 		 128 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  38.35 
 
 		 133 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  38.35 
 
 		 133 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  38.76 
 
 		 133 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  38.35 
 
 		 132 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  39.1 
 
 		 128 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  39.39 
 
 		 144 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  39.1 
 
 		 123 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  39.39 
 
 		 142 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  40.74 
 
 		 128 aa  89.4  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  38.35 
 
 		 127 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  40.6 
 
 		 127 aa  88.6  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  37.59 
 
 		 133 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  39.39 
 
 		 122 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  40.31 
 
 		 133 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  38.35 
 
 		 127 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  39.1 
 
 		 127 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  38.64 
 
 		 124 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  41.53 
 
 		 153 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  36.84 
 
 		 132 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  38.64 
 
 		 144 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  38.35 
 
 		 126 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  40.6 
 
 		 127 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  41.35 
 
 		 130 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  39.85 
 
 		 127 aa  87  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  37.59 
 
 		 127 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04655  iron-sulfur cofactor synthesis protein (Isu1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06770)  39.02 
 
 		 173 aa  86.7  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.593219 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.31 
 
 		 134 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  39.85 
 
 		 153 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  41.09 
 
 		 150 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  37.59 
 
 		 127 aa  86.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1657  scaffold protein  40 
 
 		 128 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.269786  hitchhiker  0.00054209 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.31 
 
 		 135 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  40.6 
 
 		 128 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.85 
 
 		 133 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1443  scaffold protein  37.59 
 
 		 148 aa  85.9  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0899521  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  38.35 
 
 		 127 aa  85.9  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>