More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2001 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_2001  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
421 aa  859  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  1.77738e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2235  enolase  79.29 
 
 
423 aa  696  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2093  phosphopyruvate hydratase  71.39 
 
 
416 aa  618  1e-176  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.470329  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0200  phosphopyruvate hydratase  70.64 
 
 
416 aa  611  1e-174  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.969162  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0615  phosphopyruvate hydratase  70.88 
 
 
416 aa  610  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1786  phosphopyruvate hydratase  70.17 
 
 
415 aa  607  1e-173  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.897912  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1844  phosphopyruvate hydratase  65.16 
 
 
414 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1668  phosphopyruvate hydratase  65.16 
 
 
414 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2046  phosphopyruvate hydratase  64.99 
 
 
414 aa  541  1e-152  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.206707  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0152  phosphopyruvate hydratase  63.48 
 
 
414 aa  534  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  61.18 
 
 
422 aa  525  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  58 
 
 
424 aa  516  1e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  60.24 
 
 
431 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  61.95 
 
 
430 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  60 
 
 
427 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  60.24 
 
 
431 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  59.91 
 
 
431 aa  513  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 
431 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  61.61 
 
 
429 aa  508  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  62.44 
 
 
430 aa  510  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  60.48 
 
 
433 aa  509  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  62.77 
 
 
431 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 
431 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  59.14 
 
 
429 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  8.60602e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 
431 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  62.77 
 
 
431 aa  510  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 
431 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  61.46 
 
 
430 aa  506  1e-142  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  7.44717e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  58 
 
 
422 aa  505  1e-142  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  60.1 
 
 
428 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  59.72 
 
 
429 aa  504  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  58.19 
 
 
428 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  60.6 
 
 
427 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  59.43 
 
 
425 aa  498  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.15444e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  59.38 
 
 
429 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  60.39 
 
 
429 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  59.52 
 
 
427 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  60.6 
 
 
427 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  59.38 
 
 
429 aa  498  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1424  phosphopyruvate hydratase  61.52 
 
 
424 aa  498  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  58.68 
 
 
428 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.6481e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  59.1 
 
 
431 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  59.8 
 
 
428 aa  496  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  58.33 
 
 
425 aa  498  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.21511e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  60.55 
 
 
429 aa  494  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  60.64 
 
 
426 aa  495  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  58.74 
 
 
424 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  56.77 
 
 
427 aa  492  1e-138  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 
427 aa  491  1e-138  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2476  phosphopyruvate hydratase  60.15 
 
 
430 aa  491  1e-138  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.846458  normal  0.0424446 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1636  phosphopyruvate hydratase  59.1 
 
 
438 aa  493  1e-138  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  2.92411e-11  hitchhiker  0.000813655 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 
431 aa  492  1e-138  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 
427 aa  491  1e-138  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  61.04 
 
 
429 aa  491  1e-138  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  58.09 
 
 
432 aa  491  1e-138  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 
431 aa  493  1e-138  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  58.85 
 
 
427 aa  494  1e-138  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 
431 aa  492  1e-138  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 
427 aa  491  1e-138  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  59.76 
 
 
429 aa  492  1e-138  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 
431 aa  493  1e-138  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.35484e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1870  phosphopyruvate hydratase  59.1 
 
 
438 aa  492  1e-138  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000338918  hitchhiker  0.000814995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  60.6 
 
 
427 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 
427 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  59.7 
 
 
428 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  58.29 
 
 
431 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 
427 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 
427 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 
427 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 
427 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  59.7 
 
 
428 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  60.1 
 
 
427 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  60.6 
 
 
427 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  55.56 
 
 
431 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  59.51 
 
 
429 aa  489  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  59.85 
 
 
427 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 
427 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  60.6 
 
 
427 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 
427 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 
427 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 
427 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  60.35 
 
 
427 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2161  phosphopyruvate hydratase  58.92 
 
 
430 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.844141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  58.55 
 
 
423 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  60.6 
 
 
427 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2195  enolase  55.24 
 
 
426 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  4.97652e-07 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  58.33 
 
 
426 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.9797e-08  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  58.1 
 
 
425 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  60.1 
 
 
427 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  60.78 
 
 
427 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  60.35 
 
 
427 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  59.25 
 
 
424 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  60 
 
 
429 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  58.53 
 
 
429 aa  483  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  58.19 
 
 
430 aa  483  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  6.9334e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  59.42 
 
 
428 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  59.25 
 
 
425 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02841  phosphopyruvate hydratase  57.7 
 
 
433 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  57.21 
 
 
431 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  59.1 
 
 
427 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>