36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1956 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
70 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  80 
 
 
85 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  43.24 
 
 
87 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.72 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  41.56 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  39.74 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.33 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  32.1 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.08 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.84 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  47.4  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  30 
 
 
85 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.65 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  32 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  22.67 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  52.94 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  28.75 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  40 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  44.12 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  39.13 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  29.73 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  43.9 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  41.86 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1880  hypothetical protein  39.39 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  35.53 
 
 
91 aa  43.9  0.0009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  29.27 
 
 
92 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  44.12 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  32.05 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.08 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  35.19 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.84 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  22.89 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  28.57 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  24.1 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.48 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.62 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>